主要职责是：组织和协调新疆遥感科技力量，开展遥感科研和应用项目的研究，促进遥感技术在新疆的应用和发展；组织与开展遥感技术的国际合作与交流；组织与开展遥感技术人员的国内外教育和培训；组织和协调遥感数据、资料、技术的共享与服务。

新疆遥感中心按照开放和集成的原则，跨部门设立了5个业务部，这些业务部门集中了新疆最强的遥感科技力量，拥有研究员、高级工程师近 50位，科技人员300多名。中心还成立了协调领导小组和专家委员会，特聘了十名国内资深遥感专家为中心的顾问，请自治区相关部门的领导和知名专家共同为新疆遥感工作的发展出谋划策。