兵库医科大学的建学精神为“对社会福祉事业的奉献”“对于人类最深的爱”“对人类进行幅度广泛的科学理解”，并将此建学精神作为教育理念。教育目标是培养充满人情味的，将患者的事放在最重要位置进行思考的，具有广泛幅度教养和较高伦理观，以及基本的医学知识和医疗技术的良医。为推进此教育目标，于2007年与关西学院大学缔结了“学术交流相关协定”。从2008年开始，1年级学员全员都会每周前往关西学院大学一次，与关西学院大学学生们一起接受除英语以外的人文、社会系科目讲座。以此来使学生和外校学生进行交流，培养更广阔的视野和更多样的价值观。