2003年10月1日由旧高知大学与旧高知医科大学合并而成。

高知大学设有人文学部（人类文化学科、国际社会沟通交流学科、社会经济学科）、教育学部（学校教育教员养成课程、终身教育课程）、理学部（理学科、应用理学科）、医学部（医学科、看护学科）、农学部（农学科），大学院设有综合人类自然科学研究科（硕士课程：人类社会科学专攻、应用自然科学专攻、医学专攻）、教育学研究科（学校教育专攻、教科教育专攻）、理学研究科（博士前期课程：数理情报科学专攻、物质科学专攻、自然环境科学专攻、博士后期课程：应用理学专攻）、医学系研究科（硕士课程：医科学专攻、看护学专攻、博士课程：生命医学系专攻、神经科学系专攻、社会医学系专攻）、农学研究科（暖地农学专攻、森林科学专攻、栽培渔业学专攻、生产环境工学专攻、生物资源科学专攻）、黑潮圈海洋科学研究科、联合农学研究科。