2004 年,公司的原股东日本恒星股份有限公司将其持有的本公司发起人股份全部转让给世纪方舟投资有限公司。2006 年,公司的原股东中国科学院合肥智能机械研究所将其持有的本公司发起人股份全部无偿划转给中国科学院合肥物质科学研究院。2006 年6 月15 日,公司股权分置改革方案经中华人民共和国国有资产监督管理委员会批准(国资产权【2006】656 号),并于2006 年6 月20 日获得公司股权分置改革相关股东会议审核通过。公司全体非流通股股东通过向方案实施股权登记日登记在册的流通股股东按每10 股支付3.3 股股票对价,共支付825 万股股票给全体流通股股东,获得其持有的非流通股股票上市流通权。2006 年7 月4 日公司股权分置改革方案已实施完毕,公司总股本仍为7,500 万股,其中：有限售条件的流通股为4,175万股,无限售条件的流通股为3,325 万股。 2007 年7 月,合肥科聚高技术有限公司、中科院合肥物质科学研究院、安徽省信息技术开发公司、世纪方舟投资有限公司四家单位所持本公司部分股票限售期截止,截至2007 年末,公司总股本仍为7,500 万股,其中：有限售条件的流通股为27,276,164 股,无限售条件的流通股为47,723,836 股。