昆明蟹甲草，多年生草本，根状茎短粗，直径1.5—2厘米，有多数褐色较粗的须根。茎单生，高(30)50—90厘米，硬坚，绿色或基部带紫色，具多数纵条纹，无毛，下部叶缩小或枯萎，其余的叶多集中于茎的中部或中上部，渐变小，在四分之一处至近中部以上呈塔状圆锥状排列。

叶全形宽卵形，长7—10厘米，宽6—11厘米，基部微心形，截形或宽楔形，掌状3—7深裂，裂片宽倒卵形或匙形，顶端钝或稍尖，顶生裂片多少分裂，侧生裂片2浅裂或深裂，边缘具疏齿或仅有具小尖的细齿，质地较厚，上面深绿色，下面浅绿色，两面无毛，掌状脉，叶脉在下面明显凸起。叶柄短于叶片之半，具楔状短翅，基部无耳。

头状花序多数，在茎端或上部叶腋排列成有分枝的狭圆锥花序，花序分枝斜上，头状花序向上又排成总状，下垂，无毛或被极疏的短柔毛，下部的苞片与叶相似，但变小，较上部的苞片线形或线状披针形，长5—6毫米；花序梗细，长(2)3—5毫米，有1—2钻状线形小苞片，下垂；总苞圆柱形，长8—9毫米，宽1.5—2毫米；总苞片3，草质，线状披针形或狭披针形，长7—9毫米，宽1—1.5毫米，淡褐色，顶端钝或稍尖，被微毛，具狭或较宽的膜质边缘，外面无毛，小花3—4，花冠黄色，长6—7毫米，管部长2毫米，檐部宽管状，裂片披针形，长约2毫米；花药伸出花冠，基部具长尾；花柱分枝顶端截形，被乳头状微毛。