2014年6月30日，云南省发展和改革委员会批复昆明市轨道交通6号线工程初步设计。7月1日，昆明轨道交通6号线二期工程开工建设。

2016年3月5日，昆明轨道交通6号线一期工程停运改造。

2017年6月15日，昆明轨道交通6号线二期工程首段隧道贯通。8月29日，昆明轨道交通6号线一期完成提升改造工作，与昆明轨道交通3号线同步开通试运营。

2018年5月18日，昆明轨道交通6号线东郊路站主体结构封顶。

2019年3月20日，昆明轨道交通6号线二期工程隧道盾构全线洞通。

2020年9月23日，昆明轨道交通6号线二期工程开通试运营。

2024年9月30日，地铁6号线客流量达7.45万人次，单线客运量再创历史新高。

截至2020年9月，昆明轨道交通6号线全长24.82千米，全线最大站间距为9.73千米（东部汽车站至大板桥站）、最小站间距为0.893千米（岔街站至东郊路站），全线设8座车站。

昆明轨道交通6号线一期工程位于盘龙区、官渡区，是连接昆明市主城区与长水国际机场的轨道快线。线路起点为东部汽车客运站，沿昆明机场高速公路路侧，经两面寺村、金马村、瓦角村、大板桥镇至昆明长水国际机场，线路全长约18.018千米。

昆明轨道交通6号线二期工程线路起于塘子巷站，经拓东路、东郊路，下穿菊华立交后，线路拐向北侧经归十西路、虹桥立交，在东部客运站附近接一期工程东部客运站。

据2020年9月23日昆明轨道交通官网显示，昆明轨道交通6号线各站点的首末班车时刻如下：

截至2013年6月27日，昆明轨道交通6号线日均客流量5226人次。

截至2017年11月，昆明轨道交通6号线日均运送乘客约1.53万人次。

昆明轨道交通6号线列车采用6节B型编组，列车一共6节，每节长近20米、宽2.8米、高3.8米，每节重量将近35吨。

截至2020年9月，昆明轨道交通6号线设放马桥停车场、小哨车辆段。

放马桥停车场：位于东部客运站东侧，与昆明轨道交通3号线公用。

小哨车辆段：位于大板桥站与机场前站段区间。

东郊路站为昆明轨道交通6号线二期工程自西向东的第三座车站，该站基坑深度最深达30米，相当于10层楼高度，为昆明轨道交通6号线全线最深的车站。

东郊路站至菊华站右线隧道区间地质以砂层、粉砂层、粘土层为主，局部分布泥炭质土，该区间面临下穿二环匝道、连续下穿密集高层建筑群、4号线交叉段磨桩、林俊苑小区和冶金宿舍楼磨桩、盾构重叠始发、下穿昆明西货场铁路既有线、下穿明通河、穿越上软下硬地层等重大风险源，同时克服盾构施工场地狭小、拆迁安置居民、施工组织复杂等难题。

6号线三期

2023年1月，昆明市交通运输局回复，轨道交通6号线三期工程已纳入昆明市轨道交通第三期建设规划按程序报批，具体动工时间暂无法确定。轨道交通工程为重大的基础设施工程，建设工作需要分阶段逐步推进。

昆明轨道交通6号线一期工程整体设计风格注重速度感和中国传统，文化主题定位为云南映像——机场专线，“一站一景、站站识别、特色集中、景景相连”成为设计的主旨。机场中心站将具象化的“孔雀翎”造型元素有序排列，提炼其色彩元素及造型元素，呼应了昆明轨道交通6号线“云南映象”的线路主题。

昆明轨道交通6号线和昆明轨道交通1、2、3号线对接换乘，形成昆明地铁“十字”结构主干线网，将主城西区、长水机场、火车南站、北部汽车客运站、呈贡新区等串联起来，实现快速轨道交通的连接。（云南网 评）

昆明轨道交通6号线二期工程与一期工程贯通运营后，直接连通了昆明主城核心区和长水国际机场，将大幅提升主城各区域往来机场的便捷度，更好地服务于航空港与主城的客运需求。（云南省发展和改革委员会 评）