昆虫分子生物学是将分子生物学技术应用于昆虫学研究，以深化对昆虫生命本质的了解。它包括基础和应用两方面的研究。基础方面主要研究昆虫基因组(genome)和基因的组织、结构、定位、功能、表达、调节、进化等，在分子水平上解答昆虫学传统学科所难以解答的问题；应用方面主要是根据基础研究中在分子水平的新发现，通过基因工程、基因转移等手段，研究、设计害虫治理的新对策，及保护、改良益虫的新途径，其目标就是经济昆虫的生物工程。