昌吉学院图书馆前身是一九五九年成立的昌吉师范学校图书室，一九八一年昌吉师范学校与昌吉州教育学院合署办学，一九八六年五月，升格为昌吉师范专科学校，于一九八七年四月正式设立图书馆机构和编制，一九九八年十一月图书馆楼建成；二00一年五月，由昌吉师范专科学校与昌吉州教育学院、昌吉师范学校合并成立昌吉学院，三校图书馆随之合并。目前，由北校区图书馆楼、南校区分馆组成，总面积6300平方米，设有8个流通书库、4个阅览室，阅览座位588个，提供图书外借、报刊阅览、参考咨询、文献复制、数据库检索等服务。

我馆拥有比较丰富的馆藏资源，截止到2010年12月，我院图书馆馆藏印刷型图书文献512771册、外文原版图书1013册、电子图书94508册，各系资料室藏书48282册。图书馆每年订购纸质中文图书10万册，中文期刊700余种。目前，已初步形成了一个以本校重点学科为主，各学科共同发展，网络资源占有一定优势的馆藏体系。