1958年6月，经内蒙古自治区人民委员会批准，昭乌达盟人民委员会改称昭乌达盟行政公署，为内蒙古自治区人民委员会的派出机构，不再行使一级地方政权的职能。至1968年1月，昭乌达盟行政公署先后设有办公室、计划委员会、经济委员会、科学技术委员会、基本建设委员会、农牧办公室、财贸办公室、文教办公室、民政局、民族宗教事务局、人事局、监察处、公安局、劳动局、农业局、畜牧局、林业局、水利局、农机局、农管局、水产局、气象局、工业局、交通局、邮电局、电业局、城建局、财政局、商业局、粮食局、税务局、外贸局、教育局、文化局、卫生局、计划生育委员会、体育运动委员会、广播事业管理局、档案局、统计局、物资局、标准计量局等工作部门。时辖阿鲁科尔沁旗、巴林左旗、巴林右旗、克什克腾旗、翁牛特旗、喀喇沁旗、敖汉旗、林西县、宁城县、赤峰县、赤峰市。