2001年9月任江苏省政协主席、党组书记。

2003年3月至2008年3月任十届全国政协社会和法制委员会副主任，

2009年6月退休。

是中共十三、十四、十五大代表，中共十三、十四、十五次全国代表大会上当选中央纪律检查委员会委员；第九、十届全国政协委员，全国政协社会与法制委员会副主任委员；中央巡视组组长。江苏省九次党代会代表，九届省委委员，省纪委委员、常委；省八、九届人大代表，省八届政协委员。

1953年4月曹克明同志到南京三O七厂工作，从车间计划员一步步成长为主要领导。在担任车间计划员、组长期间，积极加强管理，使所在近千人车间的生产管理工作逐步走向制度化、规范化。担任中层干部后，狠抓基础工作，制定系统规程、新产品生产等制度，实施产品研制长远规划和年度计划，促进了工厂任务的完成。“文革”期间，先后担任厂生产指挥组副组长、革委会副主任，始终坚持原则，实事求是，敢于讲真话，一心扑在工作上，不受干扰抓生产、基建等各项工作，为国防现代化建设作出了应有的贡献。党的十一届三中全会后，先后担任厂党委副书记、副厂长、党委书记、厂长，认真贯彻党中央提出的加速发展经济建设的主导方针，大胆探索企业改革新路，推动工厂转轨变型。重视企业长远发展，在保证国防科研生产的同时，着力加强产品开发，取得了较好的经济效益。适应商品经济要求，注重市场开拓，加强经营开发，促进企业由生产型向生产经营型转变。1984年航天部授予其劳动模范称号；1986年全国总工会授予其“五一”劳动奖章和全国优秀经营管理者称号，江苏省委作出决定，号召全省各级领导干部、全体共产党员向曹克明同志学习，江苏省人民政府授予其文明标兵称号；1987年获航天部优秀经营管理开拓奖。

在担任江苏省纪委书记期间，按照中央、中纪委和省委的要求，认真抓好党风廉政建设和反腐败斗争，收到显著效果。积极推进党员领导干部廉洁自律工作，在县以上党政机关开展反腐倡廉教育，较早地抓了不准党政机关和领导干部购买、换乘进口豪华轿车等工作。认真组织查处违法违纪案件，集中力量查处大案要案，先后组织协调纪检监察机关、司法机关和有关部门查处了一批有影响的大案要案，为全省、全国反腐败斗争深入开展作出了突出贡献，1996年被中纪委记一等功。

积极开展专项治理和纠正不正之风工作，组织各地各部门开展制止公费出国出境旅游、制止公路航道“三乱”、治理基建工程中的不正之风以及剖析非正常亏损企业等专项治理，取得了较好成效。大力开展宣传教育工作，及时通过新闻媒体向社会通报大要案查处情况，宣传反腐败斗争的阶段性成果。

任省委副书记兼省纪委书记期间，还分管统战、政法等工作，能够统筹兼顾、突出重点，注重调查研究，及时提出指导意见。在统战工作方面，坚决贯彻执行中央统战政策，充分调动省民主党派、工商联及无党派代表人士的积极性，尊重党外人士意见，为他们知情、参与和监督积极创造条件。在政法工作方面，坚持严打方针，绝不手软。注重抓好政法队伍建设，预防地方和部门保护主义，对执法办案中的疑难问题，及时组织协调解决。

担任省政协主席后，对政协工作殚精竭虑，全身心地投入，不断开拓新思路，并认真付诸实施。围绕省委、省政府的重大决策部署，对全省经济社会建设中的重点难点问题组织调查研究，积极建言献策。注重提高参政议政质量，组织形成了一大批高质量的调研报告和建议案，对江苏经济社会发展提出了许多宝贵意见。重视做好群众工作，对每一封群众来信都亲自阅看，批示办理。注意与党外人士广交朋友，广泛团结各阶层爱国人士。

担任全国政协社会和法制委员会副主任后，认真履行职责，广泛联系委员和各界人士，围绕国家社会和法制建设中的重大问题，深入开展调查研究，认真听取各方面的意见建议。

2003年12月至2005年6月担任中纪委、中组部第一巡视组组长，先后赴海南、湖北、广东三省开展巡视，严格落实中央有关要求，较好地完成了各项巡视任务。从领导岗位退下来后，仍然关心改革开放和现代化建设，关心党风廉政建设和政协工作，表现了一位党员领导干部忠诚于党的事业，全心全意为人民服务的高尚品质和革命精神。

2014年9月2日6时55分，中国共产党的优秀党员、忠诚的共产主义战士，十届全国政协社会和法制委员会副主任，政协江苏省第八届委员会主席、党组书记曹克明同志因病在江苏南京逝世，享年81岁。

2014年9月4日上午，曹克明同志遗体送别在南京殡仪馆举行。

曹克明同志逝世后，习近平对他的逝世表示悼念，向其家属表示慰问，并送了花圈。俞正声、刘云山、王岐山、刘延东、李源潮、赵乐际、胡锦涛、朱镕基、李瑞环、贾庆林、尉健行、贺国强、赵洪祝、张庆黎、王刚、回良玉、张怀西、孙家正送了花圈并向其家属表示慰问。

曹克明同志的一生是革命的一生，战斗的一生，光明磊落、清正廉洁的一生。他始终胸怀共产主义理想，坚定社会主义信念，英勇奋斗，不怕牺牲，对党和人民忠心耿耿，对工作兢兢业业，恪尽职守，言行一致地履行了为共产主义奋斗终身的誓言。他坚持讲党性、讲原则、讲大局，始终把党和人民的利益放在首位。他艰苦朴素，淡泊名利，作风正派，为人坦诚，对家属和身边工作人员要求严格，始终保持共产党员高度的政治觉悟和高尚的革命情操。（《新华日报》发）