2005年8月被批准为离休。

曾任针刺原理研究所所长、医学神经生物学国家重点实验室主任、世界卫生组织传统医学中心主任、全国针灸学会第一届副会长、针刺麻醉研究会理事长、国务院学位委员会学科评议组（中西医结合）第一、二、三届成员等职。

2022年7月16日11时34分，中国共产党党员、解放战争时期参加革命的享局级离休干部、原上海医科大学基础部主任、医学神经生物学国家重点实验室创始人、复旦大学上海医学院(原上海医科大学)神经生物学教授、博士生导师曹小定同志因病医治无效，在华山医院逝世，享年92岁。

曹小定长期从事中西医结合针刺原理研究，在徐丰彦、张香桐教授的指导下，坚持基础研究与临床实践紧密结合，运用现代科学方法探索针刺镇痛和针刺治病的机理，是国内最早从事该领域研究的专家之一，是中国中西医结合学科针刺研究领域的优秀学术带头人，三次受到周恩来总理的亲切接见。由曹小定领衔开展的针刺镇痛原理研究，两次获得卫生部甲级奖。

曹小定曾担任国家“七五”、“八五”科技攻关针刺研究课题全国协作组组长，两次获得集体表彰，并被评为先进个人。“针药结合提高镇痛作用的临床应用与机理研究”荣获国家科技进步奖三等奖；“针药结合时中枢阿片肽系统与多巴胺系统之间关系的研究”荣获国家教委一等奖。“内阿片肽在电针抑制实验性癫痫发作中的作用”研究荣获国家教委科技进步奖二等奖；“针对改善创伤应激或吗啡介导的免疫抑制效应”研究荣获教育部二等奖。

曹小定始终坚持践行“以科研任务带动学科建设，以学科建设促进基地建设，以基地建设推动新学科建设”的创新发展理念。在改革开放初期，曹小定以高度执着的事业心在上医率先建设了中西医结合基础国家重点学科；1975年起正式组建针麻研究组（后为针刺原理研究所、神经生物学教研室）；1982年与张镜如教授一起，率先主编神经生物学讲义，开展本科生、研究生课程教学，后建立神经生物学教研室。

1992年，曹小定创建医学神经生物学国家重点实验室并担任首任主任，为上医神经生物学学科建设打下坚实基础，为中国神经生物学科和中西医结合领域人才培养做出了突出贡献。她积极开展对外交流，促进针刺疗法走向世界。1997年，曹小定登上美国国家卫生研究院（NIH）大礼堂的讲坛做大会报告，为美国NIH针刺疗法听证会通过“针刺疗法安全有效”的最终结论做出了重要贡献。

曾获国家教委、国家科委颁发的全国高等学校先进科技工作者、国家“七五”“八五”科技攻关先进个人、全国侨联“为八五计划十年规划作贡献活动”先进个人、上海市“三八”红旗手、上海市“巾帼建功”先进个人、上海市中西医结合优秀工作者等荣誉称号。

博士：夏萤，获首届（2020年）Sheikh Zayed国际传统医学奖针刺研究（Acupuncture）的金质奖章。