有机小分子是指相对分子质量为100~1000，含碳数在30左右的有机化合物。细胞中的有机小分子主要有四类：单糖(monosaccharide)、脂肪酸(fatty acid)、氨基酸(amino acid)和核苷酸(nucleotide),它们约占细胞内有机物总量的10%，是构成生物大分子的基本单位。