他秉性聪敏，幼时仅上3年小学，后自学中医典籍成才。因其父母患热病去世，自己也几因热病而丧生，遂对伤寒病学、温病学倍加努力，而成专长。23岁时行医问世，触手成春，一举成名。神木、榆林两地城乡患者，多慕名就医，应接不暇。

后迁居榆林行医。解放后，任榆林地区医院中医科主任等职，又受西医启发，相得益彰，医术更佳。除擅长治疗伤寒、温病诸症，对内、外、妇、儿等科及针灸，亦很有研究。他坚持“遵古不泥古，辨证施治，不拘一格”的治病原则，每临症必详究其因，细辨其症，往往药到病除。因此深得群众信赖，多次当选榆林县人民代表，陕西省政协委员。世人公认为全省名老中医。

“文化大革命”中，杭逢源遭到无理批斗，被贬回乡。1970年病殁，终年58岁。