在Fettel十岁时，Alma利用异能与儿子的意识融合，即后来的“思想同步”。通过母亲的精神控制，Fettel杀害了好几名负责该计划的研究员，随后计划也因这场意外而终止，同时Alma被移出生命维持装置，整个起源设施遭封锁并弃置。然而，要为起源计划的恶行负责的人们，低估了Alma的力量与愤怒。

尽管Alma已身亡，她残留的有毒生命物质使围绕着起源工场的Auburn工业区受到大规模感染。ATC总裁Genevieve Aristide回到废弃的ATC地窖，企图重启起源计划，但在她派出的调查部队无一返回后决定放弃这个徒劳无功的念头。可这时琴弦已被触动——Alma的意识将再度被唤醒。

在另一次的“思想同步”里，Alma的灵魂将被监禁且已是成人的Fettel释放，下令“把他们全都杀光” 。Fettel利用大批在他精神控制下的克隆士兵对ATC总部进行围攻，并对和起源计划扯上关系的人们逐个进行拷问。

除了 Fettel与他的部队外，另一个制造混乱的存在——Alma利用她强大的超能力进行复仇，她会令受害人产生可怕甚至危险的幻觉，被派遣牵制Fettel行动的队伍遭到Alma的异能攻击，他们的肉身瞬间被溶解，只剩下被烧焦的骸骨埋在血浆与肉块之中。

随着Alma在地窖被释放，F.E.A.R.小队任务彻底失败而引起的起源设施大爆炸，Alma的亡灵因此更具威胁性，影响了费尔波特城大部分地区。有着更多在她支配下的可怕怪物，Alma实现“愿望”的威力比以往任何时候都更大。当那些使她受尽折磨的人们成为她的亡魂，当她完全得到解放，她的“愿望”又会是什么？

不论任何人试图进入Auburn市区都必须十二分谨慎，Alma随时随地都有可能现身，等到那时，你会听到她若隐若现的嗓音，毛骨悚然的笑声，还有无线电里那些刺耳难辨的异常音频……

故事发生在一代大爆炸前30分钟，一代主角在追捕Paxton Fettel过程找到的各类证据，都证明ATC总裁Genevieve Aristide有罪。二代主角贝克特是三角洲部队的成员，他和队友前往Genevieve Aristide的住所，逮捕她。但是Genevieve Aristide的住所，正被ATC董事会雇佣的佣兵攻击。当主角找到Genevieve Aristide时，她对主角说起Harbinger计划，并称主角和他的队友是对付Alma的唯一希望。当她要详细解释时，一代主角引爆了反应堆，产生了巨大的爆炸，而主角则被震晕。

主角苏醒时，发现Genevieve Aristide指挥的几个医生正对他进行手术。当他完全醒来后，他发现他在一个地下医院，而ATC董事会的雇佣兵正在准备炸毁医院，以毁尸灭迹。在逃往地面的过程中，主角遭到Alma的袭击，而一个自称Snake Fist的人，对他提供帮助，并告诉他因为手术，主角的精神力量大大增加，变得更加醒目，造成Alma要吸收主角。 逃到地面后，只剩下四人的队伍，前往Snake Fist藏身的Wade小学。在小学中，主角发现这里是ATC “Paragon“计划的实验场所。同时主角还得知所谓的”Harbinger“计划就是制造类似一代中Paxton Fettel的精神力量指挥官，以控制克隆士兵。而主角和另一幸存队友Keegan是最有希望成功的。在地下实验室，主角找到了实际上是ATC研究人员的Snake Fist。被克隆杀手杀死之前Snake Fist告诉主角，要战胜Alma，就需要Still Island上（一代中囚禁Alma的地方）的精神力量加强器，加强主角的精神力量，战胜Alma。

在赶往Still Island途中，Keegan独自一人离开了，主角追了上去。但是因为克隆士兵的攻击，而一直没追到。最后主角与队友会合后，与女上尉一起前往精神力量加强器。当上尉要开启加强器时，Genevieve Aristide出现，打死了上尉i，阻止加强器的运行。她告诉主角因为Origin计划的败露，她对董事会已经失去了利用价值。为了拥有与董事会谈判的砝码，她要囚禁Alma。以Alma作为谈判筹码。而方法就是将Alma关在这个加强器中，游戏开始时手术就是加强主角的精神力量，而Alma对精神力量极其敏感，这样主角就成为了诱饵，将Alma引到Still Island。 这时Alma突然出现，Genevieve Aristide将Alma和主角一起关在了加强器里。

主角发现自己处在一个幻境之中，当他要开启加强器时，Keegan突然出现攻击主角，同时叫嚷着为什么不是我。最后主角击败了Keegan并启动了加强器。这时主角发现自己退出了幻境并被封在加强器内。突然加强器打开，主角发现Alam站在他面前，身后是一片废墟。而且Alma怀孕了。Alma走向主角，把他的手放在肚子上，主角听到了一个女声叫唤”Mummy“（结局很OX...很和谐...是主角把Alma的肚子搞大了...很离谱的结局- =打半天等于白打）

起源计划的结局留下了很多悬念。这些悬念包括

Alma肚子里的孩子是否是她与Becket的

Alma看中Becket仅仅是为了Becket一般的精神力吗（游戏中的资料显示与Becket一起作战的Keegan的精神力是“优秀”，而Becket的精神力仅仅是“杰出”）

Alma怀孕是否是为儿子Paxton Fettel找一位新的克隆军队领袖（Paxton Fettel在《极度恐慌：重生》中被一位克隆人士兵所找到）

游戏中有很多可收集文档，文档列出了如下计划

Icarus 计划

ATC在1973展开的关于微重力下人体状况的生物工程方面的研究。这个计划因为Perseus计划而取消。现在这个计划所剩下的不过是几个拥有快速反应和强大力量的超级士兵原型体。

Origin计划

这个计划原本是通过Alma的DNA来制造原型体，但是Harlan Wade认为精神力量未必就是完全基因方面的。所以他使Alma怀孕，产下了两个原型体。而Alma则一直处在人造昏迷状态。

Alma产下的第一个原型体（主角），起初被认为是失败。过一段时间后，Alma再次怀孕并产下了第二个原型体（Paxton Fettel）。在Paxton Fettel十岁时，Alma和他拥有了精神联系，这个造成了Paxton Fettel爆走，并杀死了数名研究人员。这个事件时Origin计划被终止，研究基地被封闭，Alma的生命维持机也被暂停。Harlan Wade声称Alma在这之后六天，死去了。

极度恐慌游戏开始前，Genevieve Aristide再次启动Origin计划，她派出人员进入研究基地，并打开了封存Alma的封闭仓，这使得Alma的精神力量散播出去，并和Paxton Fettel再次发生精神联系，这次联系，造成了Paxton Fettel的反叛，也就是一代游戏的开始。

Perseus计划

这个计划包括了Origin计划中出生的Paxton Fettel。 Paxton Fettelzu作为指挥官，用他的精神力量来控制克隆部队，这支部队最后因为Alma的复苏而造反，游戏中的大多数敌人都是他们。

Harbinger计划

这时Origin 计划的后继者，目的是制造更多，更可靠的精神力量指挥官，二代主角和他的数位队友都是这个计划的选中者。在二代里的医院就是这个计划的实验基地，主角遇到了很多失败的实验品。

Paragon计划

这是一个长期的研究计划，目的是在Wade小学学生中寻找拥有精神力量天赋的小孩，将他们发展成精神力量的使用者。在小学的地下实验室内研究人员对学生进行暗示, 药物,甚至秘密手术，以激发他们的能力。Alma曾经也是这里的学生，因为她拥有的强大力量和不稳定性而被转移。

Monolith正式确认了《极度恐慌2：起源计划》的DLC包《极度恐慌2：重生》的开发，将于9月3日登陆PC，PS3和Xbox 360平台。

从9月3日开始，《极度恐慌2：起源计划》的玩家可以下载全新的DLC《极度恐慌2：重生》，里面将会包括4个全新的单人模式关卡，同时,多人游戏模式会增加”慢动作死人竞赛”模式。而在8月27号，这个下载包的试玩版将会对外发布。 　除此之外，在8月13日将会针对Xbox 360发布一个全新的《极度恐慌2：重生》主题，需要240个微软点，一个图片包价值80个微软点。而针对PS3也将发布一个新的主题，要价1.99美元。

《极度恐慌2：重生》的故事发生在《极度恐慌2：起源计划》的故事之后，讲述的是克隆士兵大举进攻，而玩家所扮演的克隆士兵F-813受到Paxton Fettel幻觉而杀死队友，背叛整个克隆军团的故事，克隆士兵根据幻觉提示找到了位于爆炸中心（即起源计划中爆炸后的城市）的Paxton Fettel，后F-813在Paxton Fettel的指令下摘下头盔露出真面目，他竟是Paxton Fettel的克隆人，最终F-813被Paxton Fettel附身

基本配置信息

推荐配置信息

移动：WSAD

填充子弹：R

射击：左键

瞄准：右键

子弹时间：ctrl，这个游戏特色技能必须多多利用,在1VN的时候帮助非常大

奔跑：按住shift再按方向（不能一直奔跑，只能奔跑一会儿）

蹲下：C

跳跃：空格

开门、拾取新武器，坐机器等互动：E

换枪：数字1或滑轮

扔手雷：G

切换手雷：5或6

照明:F

肉搏：鼠标滑轮