曾任国家计委办公厅主任、副秘书长，中国储备粮管理总公司总经理、党组书记，中华全国归国华侨联合会主席。

2004年7月 当选为第七届中国侨联副主席

2007年4月 调任中国侨联党组书记

2008年1月 当选为第七届中国侨联主席

2009年7月 当选为第八届中国侨联主席

2013年12月5日上午，由477名委员组成的中华全国归国华侨联合会第九届全委会，在北京以投票的方式选举出中华全国归国华侨联合会新一届领导集体。林军再次当选为中华全国归国华侨联合会（简称中国侨联）主席。

2017年6月9日，林军辞去中国侨联主席，被聘为中国侨联顾问。