《摩尼的二宗三际论及其起源初探》，刊《世界宗教研究》1982年第3期，页45—56。

《古代摩尼教》外国历史小丛书，商务印书馆，1983年；收入《世界古今宗教史话》，（一）北京商务印书馆，1991年，页223—263。

《敦煌本〈摩尼光佛教法仪略〉的产生》，刊《世界宗教研究》1983年第3期，页71—76。

《摩尼教入华年代质疑》，刊《文史》18辑，1983年，页69—81。

《〈摩尼教残经一〉原名之我见》，刊《文史》21辑，1983年，89—99页。

《〈摩尼光佛教法仪略〉的三圣同一论》，呈交1985年敦煌吐鲁番学术讨论会论文。

《摩尼教在回鹘复兴的社会历史根源》，刊《世界宗教研究》1984年第1期，页136—143。

《本世纪来摩尼教资料的新发现及其研究概况》，刊《世界宗教资料》1984年第1期，页1—6。

《〈老子化胡经〉与摩尼教》，刊《世界宗教研究》1984年第4期，页116—122。

《从考古发现看摩尼教在高昌回鹘的封建化》，刊《西北史地》1984年第4期，页9—16。

《摩尼教〈下部赞〉汉译年代之我见》，刊《文史》22辑，1984年，页91—96。

《唐代摩尼教与中亚摩尼教团》，刊《文史》23辑，1984年，页85—93。

《宋元时代中国东南沿海的寺院式摩尼教》，刊《世界宗教研究》1985年第3期，页103—111。

《宋代明教与唐代摩尼教》，刊《文史》24辑，1985年，页115—126。

《唐宋〈三际经〉质疑》，刊《文史》25辑，1985年，页109—114。

《吃菜事魔与摩尼教》，刊《文史》26辑，1985年，页149—155。

《龙门天竺寺非摩尼教寺辨》，刊《中原文物》1986年第2期，页105－109。

《慕阇考》，刊《文史》27辑，1986年，页61—66。

《唐代长安火祆大秦寺考辨》，《西北史地》1987年第1期，页8—12。

《印度的琐罗亚斯德教徒》，《世界宗教资料》1987年第1期，页1—5。

《论高昌“俗事天神”》，刊《历史研究》1987年第4期，页89—97。

《火祆教始通中国的再认识》，刊《世界宗教研究》1987年第4期，页13—23。

《泉州摩尼教墓碑石为景教碑石辨》，刊《文物》1988年第8期，页82—86。又附录於台北淑馨出版社

《达·伽马以前中亚和东亚的基督教》，1995年，页178—188。

《唐人奉火祆教考辨》，刊《文史》第30辑，1988年，页101—107。

《祆教的原始经典〈伽萨〉》，刊《世界宗教资料》1987年第1期，页10—14、19。

《〈阿维斯陀经〉及其研究概况》刊《西南亚研究》1989年第1期，页46—48。

《近代琐罗亚斯德教研究的滥觞》，刊《百科知识》1989年第4期，页26—27。

90年代

《火祆教的葬俗及其在古代中亚的遗痕》刊《西北民族研究》1990年第1期，页61—67，60。

《〈摩尼光佛教法仪略〉残卷的缀合》，载《敦煌吐鲁番文献研究论集》第5集，北京大学出版社，1990年，页179－201。

《伦敦藏敦煌写本〈下部赞〉原件考察》，刊《季羡林教授八十华诞纪念论文集》，江西人民出版社1991年，页871－900。

《所谓李氏旧藏敦煌景教文献二种辨伪》（与荣新江合作），刊香港《九州学刊》1992年4月第四卷第四期，页19－34；又修订附录於台北《达·伽马以前中亚和东亚的基督教》，页189—211。

《福建发现的波斯摩尼教遗物》，刊台北《故宫文物月刊》133(第12卷第1期)，1994年4月，页110－117。

《祆教净礼述略》,刊台北《辅仁大学神学论集》第102号1994年，页619－634。

《从福建明教遗物看波斯摩尼教之华化》，附录於台版《古代摩尼教艺术》，1995年，页123—137。。

《粟特文及其写本述略》，附录於台版《古代摩尼教艺术》，1995年，页109—122。

《敦煌遗书〈大秦景教宣元本经〉考释》，刊香港《九州学刊》第六卷第四期敦煌学专辑，1995年，页23—30；附录於台版《达·伽马以前中亚和东亚的基督教》，1995年，页212—224。

《唐代摩尼教术语“三常”一词考释》，刊台北《敦煌学》第20辑，1995年页47—52。

《摩尼教“三常”考──兼论景教碑“启三常之门”一句之释读》，刊饶宗颐主编《华学》第一期?广州中山大学出版社，1995年，页18—24。

《摩尼教研究之展望》，台北《新史学》第7卷1期，1996年，页119—134；转载于王元化主编《学术集林》，卷14，上海远东出版社1998年，页334—351。

《金庸笔下的明教与历史的真实》，台北《历史月刊》第98期，1996年3月，页62—67。

《一位名不见高僧传的高僧》，台北《历史月刊》第104期，1996年9月，页18—22。

《泰国大峰祖师崇拜述略》，载王见川·柯若朴主编《民间宗教》第2辑，台北南天书局发行，1996年，页1—17；经修订，作《宋大峰祖师崇拜流行泰国述略》，刊饶宗颐主编《华学》第2辑，广州中山大学出版社，1996年，页180——189。

《书评：The Manichaean Hymn Cycles Huyadagmān and Angad Rōsnān in Parthian and Sogdian 》，刊《敦煌吐鲁番研究》第2卷，北京大学出版社，1997年，页379—380。

《潮汕善堂文化及其初入泰国考略》，刊《海交史研究》1997年第2期，页82—97。

《敦煌摩尼教〈下部赞〉经名考释——兼论该经三首音译诗》，刊《敦煌吐鲁番研究》第3卷，北京大学出版社，1998年，页45—51。

《唐朝三夷教政策论略》，刊荣新江主编《唐研究》第4卷，北京大学出版社，1998年，页1—14。

《景教在唐代中国传播成功之我见》，刊饶宗颐主编《华学》第3辑，广州中山大学出版社，1998年，页83—95。

《火祆教在唐代中国社会地位之考察》，载蔡鸿生主编《戴裔煊教授九十诞辰纪念文集：澳门史与中西交通研究》，广东高等教育出版社，1998年，页169—196。

《唐季“大秦穆护祆”考》（上、下），刊《文史》第48辑（页39—46）,1999年；49辑（待刊）。

《波斯琐罗亚斯德教与中国古代的祆神崇拜》，刊余太山主编《欧亚学刊》第1辑，北京中华书局，1999年，页207—227。

2000年以来

《陈寅恪先生“胡化”、“汉化”说的启示》，刊《中山大学学报》2000年第1期，页42—47。

《西安景教碑有关景寺数量词考释》，《国学研究》第7卷，2000年。（待刊）

《唐前火祆教和摩尼教在中国之遗痕》，（澳）柳存仁撰，刊《世界宗教研究》1981年第3期，页36－61。

《摩尼教寺院的戒律和制度》，（英）刘南强撰，刊《世界宗教研究》1983年第1期，页24－37。

《华南沿海的景教徒和摩尼教徒》，（英）刘南强撰，刊《海交史研究》1987年第2期，页93－14。