1937年抗日战争爆发后，国民政府大遗退。11 月下旬苏州军人监狱将“要犯”向西转移，途中遇日机轰炸，看守逃命，林锵云砸开脚镣得以逃脱。

1938年1月林锵云辗转到达武汉，找到八路军办事处，被派回广东工作。在广州沦陷前后，先后任中共广东省委职工部副部长、南顺工委职工部部长、中共顺德组织负责人、南顺工委书记。他在南海大榄、顺德西海等地建立党支部，又在顺德大良镇蓬莱小学组织一支10多人参加的抗日游击队，以后不断扩大，成为珠江三角洲敌后游击战争的骨干力量。

1939年夏，他率领游击队三次袭击顺德大良的日伪军。

1940年夏，林锵云任中共南番中顺中心县委成员，分工负责抓武装，同时将他领导的游击队编入广州市区游击队第二支队（简称“广游二支”）独立第一中队，任中队长。他熟练动用游击战术的“伏击战”、“麻雀战”、“夜间战”，率领游击健儿打击日伪军。在西海两次战斗中，以少胜多，打退了日伪军的进攻，打死伪军“前线总指挥”祁宝林，毙伤、俘虏日伪军300余人，声威大振，游击队扩大到500多人，巩固了西海抗日游击根据地。

1942年5月，吴勤被喑杀，林被委派继吴勤任“广游二支”队司令员。

1943年2月，成立南番中顺游击区指挥部，任指挥。是年秋，指挥游击队粉碎日伪对五桂山抗日游击根据地的十路围攻。

1944年10月，林任中区纵队司令员，率领主力部队近500人，由五桂山经中山新会边横渡西江，挺进粤中，建立新鹤敌后抗日游击根据地。

1945年1月，林任广东人民抗日游击队珠江纵队司令员。同年7月，参加在罗浮山召开的广东党代表大会，被选为中共广东区党委委员。会后奉命率部到南雄开辟粤北根据地。

抗日战争胜利后，林锵云的部队奉命北撤烟台。后到华东军区，曾被调到中央城市工作部工作及任两广纵队副政委。

1948年8月，林锵云参加在哈尔滨召开的全国第六次劳动大会，被选为全国总工会执委会常务委员兼组织部部长。次年4月，出席在意大利召开的世界工联代表会以及亚澳工会会议。

1949年10月广州解放。林锵云于年底调回广东，历任中共中央华南分局常务委员、华南分局职工委员会第二书记、 中共广东省委常务委员、广东省劳动局长、广东省总工会主席、 省老根据地建设委员会副主任、主任。

1958年9月任广东省副省长，主管民政工作。他先后被选为一、二、三届全国人大代表、第三届全国人大常务委员。曾任中共广东省委常务委员。

广东省委、广东省人民政府在广州隆重举行追悼会,对他革命的一生作出了正确的评价。

1907年，十三岁的林锵云因家境困难而退学，随父到香港谋生，当了十八年的海员和洋务工人。1922年以后，他相继参加举世闻名的香港海员大罢工和省港大罢工，担任省港大罢工委员会演讲队员，接触了苏兆征、邓中夏、邓发、龚昌荣等工运领袖，思想觉悟得以迅速提高。1926年，被派任国民党南海县党部农民部干事，继而由邓发、龚昌荣介绍加入中国共产党。第二年，参加广州起义，在工人赤卫队中做政治鼓动工作。起义失败后，转到香港，任洋务工会支部书记。1928年4月，奉命潜回南海县，担任县委书记，致力于恢复各级党组织，但由于白色恐怖严重，无法开展工作，随即撤回香港。以后几年，历任香港工代会党团书记、九龙地委书记、中华全国总工会驻香港特派员兼海员总工会香港特派员。1931年冬，因叛徒出卖，下狱五十天，被驱逐出境。随后，他化装到上海找到海员总工会，获派负责太平洋航线海员的政治工作。一年后，又因叛徒出卖，押送南京，被判无期徒刑，关押在苏州监狱。在过了四年多铁窗岁月之后，抗日战争全面爆发，国民政府大溃退，苏州监狱把一批“要犯”转移内地，途中遭日机轰炸，押送人员丢下“犯人”狼狈逃命，林叔与难友们砸开镣铐，重获自由，历尽艰辛，抵达武汉八路军办事处，回到党的怀抱。

1938年夏，林叔奉调回广东，参加驻顺德理滘的南（海）顺（德）工委领导班子。为了便于开展工作，他在这年冬天住到大革命时期的战友、西海农民陈九家中。在基层群众的鼎力协助下，他根据省委的组织材料，在大良、龙眼、新隆、劳村、西海路尾围等地，找到大革命后失去联系的共产党员，重新建立大良、龙眼和新隆支部，积极筹备开展敌后武装斗争。1939年春节前后，他通过大良北门蓬莱小学教员罗永基，在其叔父、国民党广东第一游击区第二支队某大队队长罗炳名下取得“特务中队”的番号，然后在路尾围和龙眼村物色了十多人，由南顺工委派来的老红军邓贵林充当指挥员，建立起共产党在顺德的第一支抗日武装队伍。不久，日寇第二次侵占大良，“特务中队”退守龙眼，改称“顺德人民抗日游击队”，两度出击大良，截击日寇军车，杀掉一名军曹。林叔就在这个时候接替奉调东江的南顺工委书记范志远的职务。同年9月，邓贵林闹分裂，与众涌土匪卢四斤另立队伍，林叔劝告无效，只好率队离开龙眼，移驻路围围。邓离队后，生活作风日益腐化堕落，最后死于内讧。

1940年1月，日寇第二次退出大良，林叔命令顺德游击队进城，与吴勤的广游二支队共同维持县城秩序。不久，日寇又从容奇杀到，两支游击队并肩作战后，随即撤出。3月中，顺德游击队由路尾围移驻禺南大石乡，以“俊杰社基干队”的名义开展抗日活动，队伍发展到二十多人。同年夏天，南顺工委撤销，中共南、番、中、顺中心县委在西海正式成立，统一领导珠江三角洲地方和部队的党组织。中心县委书记是罗范群，林叔和刘向东、陈翔南、严尚民、谢立全、谢斌当选为委员。为了创建一支由共产党绝对领导的抗日武装队伍，中心县委经过商议，决定以顺德游击队为基础，加上一批从中山、番禺抽调来的党员和进步青年，组成广游二支队独立第一中队。10月，中队在番禺石涌成立，全队五十多人，由林叔担任中队长，黄友涯任支部书记、黄柳言任指导员，长征干部谢立全、谢斌负责军事训练和指挥工作。年底，移驻西海，着手建设西海抗日根据地。

独立中队的行动，很快引起敌人的注意，必欲除之而后快。1941年3月，驻容奇的日寇警备队三百多人向西海根据地发动首次进攻，林叔在富于作战经验的谢立全的协助下，动员军民迎头痛击，敌军死伤枕藉，狼狈撤回。但过了不久，国民党反共逆流掀起，广游二支队主力大队长刘登受拉拢，密谋拉队投靠“挺三”纵队国民兵团，被中心县委及时发现，命令吴勤和主力大队的党员干部冯扬武、林锋采取果断措施，把两个主力中队拉回西海。于是，林叔的独立第一中队一下子扩充至二百多人，战斗力大大加强。7月中，他们进攻番禺沙湾伪军何健部，歼敌一个连，并端掉伪警察所，敌人恼羞成怒，决意报复，10月17日，中秋节后十天，伪军四十三师长“市桥皇帝”李塱鸡（辅群）出动了三个团，加上补充营、护沙大队，以及八艘炮艇，合共三千兵力，从大涌口、路尾围、碧江三面分五路大举进犯西海。独立第一中队和当地的基干民兵，总共才三百多人，人数仅为敌方的十分之一，但林叔毫无畏惧，与谢立全等同志一起，沉着指挥部队，利用河涌鱼塘、蔗林桑基的复杂地形，分头抗击来犯之敌。驻陈村的吴勤大队和统战武装力量，如国民党“挺三”部队、广游二支队属下的何成大队、曾岳部队，也派出人员参战，从侧翼和外围袭击敌人。经过一天激战之后，伪军死伤五百多人，被俘三百多人，连担任总指挥的伪团长祁宝林也丧身阵中。傍晚时分，其余人马仓皇夺路逃回番禺。这场战役，被称为“西海大捷”，是华南抗日游击战中的出色战例。由于独立第一中队在战斗中担当了主力角色，表现得特别英勇顽强，连坚持反共的“挺三”副司令林小亚，也不得不亲自到西海慰问，称赞二支队“抗战有功”。

西海大捷后，独立第一中队又在1942年春节期间夜袭番禺韦涌伪军据点，歼敌九十馀人。接二连三的胜利，大大提高了独立第一中队的威望，一些统战武装如番禺沙湾的何成，榄核的杨忠，顺德五区的曾岳等，都主动向共产党游击队靠拢，请求派人帮助他们训练人员，以提高队伍战斗力。

共产党武装力量的发展壮大，引起国民党方面的猜忌，继皖南事变之后，又在全国各地发起第二次反共高潮。二支队也面临严峻考验，先是司令员吴勤被暗杀，接着，敌伪顽又默契联手，集结五千多兵力于林头、西海、广教一带，准备与共产党游击队决战。在这种情形下，林叔根据中共中央军委“在新形势下，我之斗争方针是坚持长期分散的游击战”的指示精神，决定主动撤离西海根据地，把人员分散到中山、禺南及南海、三水各地，去开辟新的游击队。上级党委批准了这一行动，命令在榄核成立南番顺游击区指挥部，委任林叔为司令员。此后，在他的领导下，建立起中山五桂山、番禺大谷围两个革命根据地，队伍继续发展壮大，为珠江三角洲游击区民主建政廓清道路，胜利捷报频传。仅番、顺方面，1944年3月，在广州市郊沥滘一举歼灭汉奸“八老虎”、“五豺狼”；5月，打新造，活捉伪区长冼尧甫；6月，攻市桥，夜袭李塱鸡老巢。继而，顺德分队在兄弟部队的配合下，乘胜回师，歼灭乌洲伪联防大队，活捉大队长胡须葵（梁葵），并分兵进驻一区旧寨和八区麦村。与此同时，中山、番禺、顺德各级民主政权开始建立。同年秋天，上级党委撤销南番顺游击区指挥部，成立广东中区游击纵队司令部，仍由林叔任司令员，抽调主力挺进粤中，与新会、鹤山、高明的兄弟部队会合，把该地区的敌后游击战推向高潮。

1945年初，广东人民抗日游击珠江纵队公开宣布成立。林叔从粤中调回，担任司令员。随后，挥师挺进西江，北上五岭，为迎接八路军南下支队扫清障碍。8月，日本无条件投降，林叔奉命率队北上山东烟台。解放战争时期，他担任两广纵队副政委，与其他领导通知一齐率队南下，配合野战军解放华南。