1988年，她被任命为纺织工业出口局局长，开始独当一面。阿罗约夫人雷厉风行的作风开始为菲律宾人所熟知。

1989年5月，她由于其出色的政绩被阿基诺夫人任命为贸易工业部副部长，分管政策研究室和服装出口。

1992年1月，阿罗约夫人决定竞选参议员，向更高的目标迈进。阿罗约夫人十多年的执教经验锻炼了她的口才，使她能够在万人集会上依然雄辩滔滔，在媒体的工作经验使她在与新闻机构打交道时游刃有余。

1992年5月，阿罗约夫人如愿以偿，当选国会参议员，她的政治生活翻开了新的一页。

当选副总统

担任参议员不久，她就被任命为四个重要的经济委员会的主席。她数次当选“杰出参议员”。她还被香港一家周刊评选为1998年“亚洲最有影响力的妇女”。她的政绩吸引了一大批追随者，于是她决定参加第二次参议员竞选。阿罗约夫人成为1995年参议员选举的“选举皇后”，所获选票不仅是当年之冠，而且超过了菲律宾建国以来任何单个候选人所获得的选票数。她开始向更高的目标——马拉卡楠宫迈进。

1998年5月当选为副总统，兼任社会福利与发展部长。

当选总统

2000年，埃斯特拉达爆出收受赌博集团贿赂丑闻和艳史秘闻。在得到菲律宾前总统阿基诺夫人等菲政坛重量级人物明确支持后，阿罗约开始与埃斯特拉达划清界限，同时她所领导的力量党和其他两个主要在野党在宿务市组成了反对埃斯特拉达的联合阵线。军方和内阁要员先后表态支持她领导的反对派。

2001年1月20日菲律宾叛乱中阿罗约接替前总统担任总统职务，成为菲律宾第14任总统。阿罗约总统在就职演说中提出：消除贫困、打击腐败、摈弃亲属政治等等。实施这个建国方案的将是一个勤奋务实的总统和一个高效廉洁的政府。

2004年5月举行的大选中获胜连任总统，6月30日宣誓就职。

2005年6月5日，菲律宾一家广播公司通过电台播放了一盘据称是阿罗约与一名选举官员在2004年大选期间的电话录音，阿罗约在电话中涉嫌示意选举官员舞弊。

2005年6月28日，阿罗约对全国道歉并为自己的行为负责任。7月8日，一直支持阿罗约的内阁成员发生分裂，10名部长级官员集体辞职并且加入反对阿罗约的阵营，令风雨飘摇中的菲政局更添动荡。

2005年6月29日，何赛·阿罗约再次被称卷入非法赌博，阿罗约宣布丈夫将暂时远居国外，为她的政治生涯作出牺牲。

2010年6月卸任总统。

2010年，卸任总统后改选家乡班巴加省众议员，顺利当选，也成为菲律宾第一位“降级”继续从政的前总统。

当选众议长

2018年7月23日，菲律宾众议院投票选举前总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约为新一任众议长。阿罗约随后宣誓就职，成为菲律宾历史上首任女性众议长。

2011年8月9日，菲律宾政府禁止因涉及贪污丑闻的前总统阿罗约出境。阿罗约被指在竞选总统期间挪用数亿比索政府资金充当竞选经费。

2011年11月18日，菲律宾选举委员会正式以“操控选举”的罪名起诉前总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约。马尼拉帕赛地区法院于2011年11月18日下午向阿罗约发出逮捕令。

阿罗约坚决否认选举舞弊、腐败等一系列指认。

2011年12月29日，菲律宾政府与中国一家电信设备制造商之间的一笔报价过高的合同，菲律宾检察官29日对菲律宾前总统阿罗约提出一项新的刑事指控。据称该合同涉及巨额回扣。

2011年11月19日，警方派遣人员前往医院，为阿罗约拍照，提取她的指纹。如果阿罗约操控选举的罪名成立，她可能在监狱里度过余生。

2012年7月25日菲律宾帕赛市地方法院批准前总统阿罗约缴纳100万比索（约15万人民币）保释。2012年10月，阿罗约又因被指控涉嫌滥用菲国慈善彩票署资金，遭警方在病房内逮捕，一直被羁押。

2016年6月30日，罗德里戈·杜特尔特就任菲律宾总统，阿罗约夫人的命运出现了转机，因为杜特尔特在竞选期间曾公开表态，如果他当选，会释放阿罗约。果然，2016年7月19日，菲律宾最高法院的大法官们19日以11票对4票的表决结果裁定驳回针对阿罗约涉嫌滥用慈善彩票署资金犯下掠夺罪的指控，下令立即将其释放。菲最高法院强调，针对阿罗约的指控缺乏充分证据。法院驳回了对前总统阿罗约掠夺政府资金的指控，并下令立即予以释放

阿罗约当天在得知自己胜诉后立即对菲国现总统杜特尔特和最高法院表示感谢。她感谢最高法院最终阻止了自己5年来遭受的不公平迫害，同时感谢杜特尔特准许有关案件能依照正常程序审理。阿罗约表示，随着菲最高法院作出裁决，希望每个人都能尊重和承认事实真相，“保持对司法制度的信任”。她也感谢自己的支持者，强调希望针对她的政治迫害能立即停止。她还表示，那些参与迫害她的人应当被追究责任。

2016年7月21日菲律宾前总统阿罗约被从监狱释放，重获自由。当地时间2016年7月25日，菲律宾前总统阿罗约现身国会。

2018年4月9日，格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约当选博鳌亚洲论坛产生新一届理事会理事。

阿罗约多次生病住院。2006年6月22日，她出席为丈夫举办的生日宴会时突感腹痛，住院两日后出院。2006年7月26日，阿罗约接见一批从黎巴嫩回国的工作人员后，感到身体不适，出现发烧、流鼻涕、咳嗽、咽喉痛、肌肉疼痛等症状。她随后被送到马尼拉市郊奎松城的圣卢克医疗中心，确诊患上了流感。

总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约给予教育系统各个不同方面持续关注，协调政府和各方面的关系并采取有效的措施。这些措施包括缓解教材储备不足；建设学校；恢复英语作为教学语言；实施基础教育课程；提高教师福利；将公立学校的教师从“变幻莫测的政治”中独立出来；主流化的远程学习和远程教育项目的开展。

总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约相信他们是菲律宾经济发展的重要引擎。她一直在推动中小企业的发展的议程。参与机构在各个缓解贫困的主要项目中收到显著的效果。贸易和工业部重点仍然是政府的中小企业计划，同时国家扶贫委员会继续帮助微型企业发展和为穷人开放市场经济。菲律宾中央银行，科学技术部，社会发展委员会也同样被要求采取措施促进中小企业发展。

马卡帕加尔·阿罗约政府在住房方面，努力使底层家庭能够支付得起的社会化住宅占比40%。私营企业应加大创新来建设更低成本的住宅，同时政府致力于改善住房市场效率。总统要求国会通过制定法案来限制城市土地价格过高，从而解决住房问题。私营企业，特别是参与房地产市场的银行被要求提供一个可持续的住房融资方案。房地产项目包括在政府与私企中工作的非正式低收入贫困员工。援助以协商安置形式延长，住房和技能训练为在贫困家庭带来有效的影响。

2004年5月10日，菲律宾举行第一次使用现代统计方法的投票选举。总统阿罗约的选举改革，能够帮助诚实的人通过公正的选举来表达自己的意愿。选举委员会的全面现代化计划有三个要素：选民登记确认，自动化计票，电子数据传输。

土地改革计划作为一个战略计划来抗击贫困和推动农村发展的战略计划，马卡帕加尔·阿罗约政府加快土地的分配并提供支持服务使农民受益。同样的方法被用于于公共土地的分配。

土地改革部、环境和自然资源部是土地的分配机构，农业用地由土地改革部分配，而公共土地则由环境和自然资源部进行分配。

阿罗约接任总统后在经济上采取一系列稳定社会、发展经济、增加就业、减少贫困的措施，加上其外交举措，使菲律宾社会经济发展渐有起色。执政期间，阿罗约一方面致力于发展经济、消除贫困，另一方面采取强硬措施打击包括绑架在内的各种犯罪活动，使曾一度被称为“世界绑架之都”的菲律宾治安状况开始好转，经济也步入健康发展的轨道。

首任期间，菲律宾人民平均薪资上涨11%，外国投资增加了26%，国内罢工现象减少了一半。

阿罗约接任总统后在政治和外交上紧随美国，强化与美国、日本和中国的关系。从中国的角度出发，阿罗约是位对华友好的总统，她将中菲关系提升到了历史的新高度。不完全统计显示，仅在2001年至2009年期间，她出访中国多达15次；2001到2007年间，她主持签订的中菲双边协议达到65个。2005年中、菲、越三国于2005年签订的《三方联合海洋地震工作协议》（以下简称《三方协议》）。根据协议，三国国家石油公司将联手收集南海协议区内的地震数据，并表达了三方联合考察石油资源储量的意愿。然而阿罗约身陷贪腐丑闻和合法性危机，一系列中菲合作项目因此受到牵连。

在任职参议员期间由于良好的政绩，曾多次被菲律宾记者杂志，菲律宾工会联合会等评为“杰出参议员”。

阿罗约被菲律宾天主教教育协会选为““年度最佳妇女”。

2001年5月13日，《亚洲周刊》将她列为“亚洲最有影响的妇女之一”。

2003年5月30日，被菲律宾国际职业妇女协会评为“年度杰出女性”，以表彰她为妇女权益作出的贡献。

2001年6月16日，被菲律宾国立大学校友会评为“最杰出校友”。

2022年12月，受聘为福建师范大学菲律宾研究中心顾问。

2023年4月，中国人民对外友好协会授予阿罗约“人民友好使者”荣誉称号。

阿罗约总统严于律己，工作勤奋，对内阁成员非常严格。阿罗约总统每天准时上下班。

阿罗约是一个相当活泼、外向的人。她的口才极佳，在记者招待会上总能够妙语连珠，诙谐幽默，因此深受媒体的欢迎和追捧，这与传统观念中总统一般不苟言笑的印象简直大相径庭。

生活中的阿罗约是真实而可爱的，在周日，她喜欢和家人呆在一起共享天伦之乐，陪丈夫打打高尔夫球，陪儿女看看影视剧，而且她还是一个不折不扣的“影视迷”。受具有华人血统的家人影响，她很喜欢看功夫片，在台湾偶像剧“流星花园”风靡东南亚的时候，也是“流星迷”一族的阿罗约还特意在总统府接见了主演言承旭。对于阿罗约而言，工作是自己责无旁贷的义务，但决不会因此而放弃真实的自我。

作为一位极具明星气质的女总统，阿罗约总统凭借的不仅仅是其美丽，她秉承了其父亲民主的作风，在当上菲律宾总统后不久，就宣布开放总统府供民众参观，以拉近与公众的距离。英国路透社的记者曾经拍摄到这么一张照片：一个菲律宾小男孩紧紧地拽住总统的手不放，而阿罗约也毫不介意地将头探出车窗，望着这个孩子，脸上露出慈祥的笑容。阿罗约总是那么随和、迷人，也正因为此，她赢得了很多菲律宾人民的信任和尊敬。美丽而亲民，使她更有独特的人格魅力。

阿罗约2001年就任菲律宾总统时年过半百，但外表看上去却显得非常年轻。当有媒体问及有何保养秘诀时，阿罗约说：“我没有美容秘密。我从没有过于担忧我的容貌。也许上帝给了我让我看上去年轻的基因。”

如果说娇美的容貌是与生俱来，那么阿罗约在着装上的高雅独到无疑又为她加分不少。阿罗约对中国的旗袍一直情有独钟。在2001年上海APEC会议上，阿罗约身着一件大红色的中国旗袍，站在众元首政要中，显得格外精致动人。后来阿罗约在总统府国宴厅宴请华文媒体主要负责人时，再次穿上了那件红色的旗袍，立马成为惹人注目的焦点。她兴奋地表示：“因为春节快到了，我特地穿上这套服装。”谈笑中，对于旗袍的喜爱溢于言表。

2002年9月，菲律宾一本名叫《Tatler》的杂志刚一上市即在首都马尼拉引起轰动，因为该期杂志的封面人物是他们的女总统阿罗约和4位政府部长。4位政府部长全都穿着一身黑西装戴着墨镜，与平时的形象判若两人，而娇小的阿罗约被四位人高马大的部长簇拥其中，明星气派十足。他们这一造型完全是照抄好莱坞电影《黑衣人》里面的两位男主角威尔·史密斯和汤米·李·琼斯的打扮，令人忍俊不禁。总统发言人解释道，该杂志是一本生活杂志，而并非像《时代》那样严肃，阿罗约只是想借此体现自己平易近人、风趣幽默的一面。