1914年，在两江师范学堂（前三江师范学堂）原址，筹建南京高等师范学校，当时为纪念两江师范学堂校长李瑞清（字梅庵，号清道人），在进香河东侧六朝松下建了三间茅屋，取名梅庵。门前有李瑞清手书的“嚼得菜根，做得大事”8字校训木匾。

1922年5月5日，中国社会主义青年团南京地委在梅庵举行成立大会，推选国立东南大学学生吴肃、候曜为负责人。

1992年，梅庵被列为南京市文物保护单位。