中心以植物基因组学国家重点实验室为基础组建。研究队伍中具有中国科学院院士1名，基金委“优秀创新群体”2个（入选者6名），国家杰出青年基金获得者7名，中科院“百人计划”入选者8名，中科院“创新团队国际合作伙伴计划”入选者5名。中心面向国家战略需求与科学发展前沿，瞄准植物基因组学研究的发展趋势，以基因组的结构研究为出发点，系统、深入地开展植物功能基因组学研究，着重于大规模新基因的克隆鉴定、功能分析和潜在应用价值的探索，力求阐明调控重要农艺性状的分子遗传机理与网络，推动植物生物技术的源头创新和转基因植物的产业化。中心力求建设具有国际水准的创新研究群体和技术平台，以形成具有国际影响的植物基因研究中心