槽柱花科的学名Brunelliaceae由模式属槽柱花属学名Brunellia的复合形式Brunelli-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“槽柱花属”中的专名“槽柱花”加上“科”字构成。其单纯的中文别名有瓣裂果科、西印度黄栌科，详见槽柱花属条目的“词源”一节。