模型集成并不仅仅囿于单纯地建立模型的连接，它与系统建模过程紧密联系．关于模型集成的研究因领域人员对模型的理解而有所不同，尤其体现在运筹/管理科学和计算机应用领域人员对此问题的认识上。

模型集成与模型合成一样针对已有模型，不同的是模型需要修改．所以模型合成是最简单的模型集成方式．模型集成有两类广泛的议题，即结构(scheme)集成和过程(process)或求解器的集成，结构集成指合并两个模型的体系以创立一个新模型．过程集成指求解过程的连接；简单地可理解为一个模型的输入是另一个模型的输出．问题是求解过程的组织序列是否可以推理出来．这里值得研究的问题很多，如化解冲突、模型表达、求解控制等．这时模型不再被视为黑盒子，而是玻璃盒子．可以访问模型的全部结构的设计是极为复杂的．目前有关研究主要在化解冲突和模型表达上。