1987年原国家体委决定将训竞四司武术处与武术研究院合并，直到1994年国家体委设立武术运动管理中心之前，武术研究院还行使着对全国武术的行政管理职能。在研究方面，通过设立部门，引进人才，对武术的技术、理论、政策、资料和气功进行研究。先后完成了具有一定影响的武术基础研究项目。对太极拳、八卦掌、形意拳、少林拳、南拳等拳种也进行了系统研究和整理工作。现正统一科研规划，实施科研课题管理办法，组织研究武术发展所面临的理论问题和技术问题，并将按照传统武术的技术特点和发展规律，研究传统武术的技术体系和发展政策。第一任院长徐才，第二任院长张耀庭，第三任院长李杰，第四任院长王筱麟、现任院长高小军。

1990年8月，中国武术协会、武术研究院办公楼在国家奥林匹克体育中心内正式建成（由霍英东先生资助）并投入使用。办公楼占地面积3361.1平方米，建筑面积6471.5平方米。2007年国家投资对办公楼进行了改扩建，使建筑面积增加到7201.5平方米。办公楼外观为白墙红顶，呈放射螺旋状，风格独特，造型新颖，给人以向上的动感。