武警森林指挥部基本任务是：承担森林防火灭火任务、根据部队所在省（自治区）政府的统一部署，保卫森林资源。此外，还承担依法执行国家赋予的维护社会稳定和处置突发事件的任务。武警森林部队实行武警总部和国家林业主管部门双重领导体制，由武警总部对其军事、政治、后勤工作实施统一领导，国家林业主管部门负责其业务工作。部队执行跨省（自治区）森林防火灭火任务时，由国家林业局统一指挥；部队执行所在省（自治区）森林防火灭火任务时，由当地人民政府统一指挥。