，成祖在“靖难之役”获胜后，被诛杀及众多建文旧臣如：卓敬、暴昭、练子宁、郭任、卢植、戴德彝、王艮、王叔英、谢升、丁志方、甘霖、董镛、陈继之、韩永、叶福、刘端、黄观、侯泰、茅大芳、陈迪等，史称：“忠愤激发，视刀锯鼎镬甘之若饴，百世而下，凛凛犹有生气。”他们的家属和亲人也被牵连，死者甚众，流放及被其它方式惩罚的人也不少。直至明仁宗即位后，大部份人始获赦免，余下的人的后代却迟至明神宗时始获赦免。

成祖不承认建文年号，以即位当年为洪武三十五年，次年改元永乐元年。虽然成祖因为反对惠帝削藩而起兵，但他即位后却跟惠帝一样推行削藩。