型体从零点几到几十微米。种类多，有球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌等。按栖息环境分为底栖性细菌和浮游性细菌两大类。结构简单，具细胞壁、细胞质膜、细胞质、细胞核等，在生物进化中处于低级水平。繁殖快，20—30min分裂一次。分布广。数量多少与水体肥力及水质优劣有密切关系。水生细菌是完成水域食物链主要环节，在代谢过程中，把有机物（包括生物尸体）分解为无机盐（磷酸盐、硝酸盐）、二氧化碳和水等，供绿色植物所利用。在水体自净和废水生化处理中细菌数量最多，是活性污泥主要构成者，呈絮状菌胶团，能很快吸附废水中有机物，在厌氧菌、好氧菌作用下，污染物质被降解和转化，使污水得到净化。细菌的过量繁殖，可引起水体污染，威胁人体健康，因此，细菌总数、大肠菌群及致病菌等是评价水体质量的重要卫生学指标。