水虱草是莎草科飘拂草属的一年生草本植物。无根状茎。水虱草秆丛生，高（1.5-）10-60厘米，扁四稜形，具纵槽，叶侧扁，套褶，剑状，基部包着1-3个无叶片的鞘；鞘侧扁，鞘口斜裂，向上渐狭窄，有时成刚毛状，长（1.5-）3.5-9厘米。

叶长于或短于秆或与秆等长，侧扁，套褶，剑状，边上有稀疏细齿，向顶端渐狭成刚毛状，宽（1-）1.5-2毫米；鞘侧扁，背面呈锐龙骨状，前面具膜质、锈色的边，鞘口斜裂，无叶舌。

苞片2-4枚，刚毛状，基部宽，具锈色、膜质的边，较花序短；长侧枝聚繖花序复出或多次复出，很少简单，有许多小穗；辐射枝3-6个，细而粗糙，长0.8-5厘米；小穗单生于辐射枝顶端，球形或近球形，顶端极钝，长1.5-5毫米，宽1.5-2毫米；球形或近球形，鳞片膜质，卵形，顶端极钝，长1毫米强，栗色，具白色窄边，花药长圆形，背面具龙骨状突起，具有3条脉，沿侧脉处深褐色，中脉绿色；雄蕊2，花药长圆形，顶端钝，长0.75毫米，为花丝长的1/2；花柱三稜形，基部稍膨大，无缘毛，柱头3，为花柱长的1/2。