当初，余国柱任江宁巡抚，淮安、扬州二府遭受水灾，余国柱上疏说：“水退之后，田还可以耕种，第二年应当照例征收赋税。”

汤斌派人重新勘察，发现水并没有退去，即使田已露出水面的地方也无法耕种，于是上疏奏请平息原先余国柱的议论。

康熙二十四年（1685年），汤斌呈上奏章说，“苏州、松江土地狭小，人口稠密，可是承担着大省百余个州县的赋税，百姓的财力一天比一天困乏。恳请皇上将苏州、松江的钱粮照征收标准减少一二成。”淮安、扬州、徐州三府再次遭受水灾，汤斌按条目列出减免赋税的事项，请求朝廷拨发五万两银子，从湖广购米赈济灾民。还不等诏令回复，汤斌就前往各州县视察救灾的情况。

朝廷获悉汤斌的禀奏后，康熙帝命令侍郎素赫协助他办理救灾事务。常州知府因为对属员失察被降职调任别处，汤斌了解到他很廉洁，就奏请让他留任。康熙帝特别下旨，允许照办。汤斌命令各州县建立社学，讲解《孝经》、小学，禁止妇女四处游荡，官府小吏、市井倡优不准穿皮衣和丝织品，焚毁不健康的书籍。苏州城上方山有座五通神祠，已有数百年．远近的人都争相前往。年轻女子生病，装神弄鬼的人就说五通神要娶她做妻子，生病的女子常常病死。汤斌没收五通神的塑像，木雕的就烧掉，泥塑的就沉到水里，并下令各州县凡有类似的祠堂全部毁掉，卸下原来的材料修建学校。教化得到普遍推行，百姓都心悦诚服。

汤斌刚正不阿，不趋权贵。当时明珠为大学士，在朝中当权，前任江苏巡抚余国柱告诉汤斌，说朝廷免除江南赋税，都是大学士明珠尽力促成的，但汤斌认为是自己的坚持，对明珠毫不理睬。考核官员时，外官纷纷向明珠送礼，却没有汤斌的属员。

康熙帝给太子胤礽选择辅导大臣，朝臣中有推荐汤斌的。汤斌将前往京城，苏州百姓哭泣挽留未成，停市三天，拦路烧香为他送行。汤斌上任后，汤斌悉心讲授，尽力辅佐太子，然而胤礽积习已久，成效十分有限。

康熙二十六年（1687年）五月，天不下雨，灵台郎董汉臣呈上奏章指责时事，语言触及当权的人。康熙帝让朝中大臣商议，明珠很害怕，担心自己承担罪责。大学士王熙说：“这是市井小人胡言乱语，应立即斩首，事情就可以完结。”汤斌后来也到朝廷，余国柱把这件事告诉他，汤斌说：“董汉臣根据诏旨议论朝政，没有处死的理由。大臣们不敢讲而小臣敢讲，我们应该自我反省啊。”康熙帝最终赦免了董汉臣的罪。

明珠、余国柱对汤斌更加怨恨，摘录他的言论向上禀报康熙帝，并找出汤斌在苏州发布文告中的话“爱民有心，救民无术”，把这作为对朝廷的诽谤，康熙帝传旨责问。汤斌只是说自己天资愚昧，过错很多，请求严加惩处。正赶上汤斌带病入朝，人们道听途说越传越广，听到的人都流下眼泪。住在意城的江南人，要击鼓为汤斌诉冤，后来知道没有这样的事，才散去。不久后，汤斌染上重病，于康熙二十六年（1687年）十月十一日病逝于工部尚书任上，终年61岁。

汤斌为官一生，身上仅有俸银八两，其友徐乾学“赙以二十金，乃能成殡”。

雍正十年（1732年），汤斌被平反，一年后入贤良祠。

乾隆元年（1736年），乾隆帝赐予汤斌谥号“文正”。

道光三年（1821年），汤斌得以从祀孔子庙。

汤斌上任潼关后体察民情，打击豪顽；招徕流民回乡屯田开荒，三年免征租课；实行保甲联防，缉拿盗贼；建立义仓，以备荒欠；创办社学，教民以德。亲自到境上接待过往清军，不使他们扰乱地方，使人民得以安居乐业。潼关人户一年多时间由不足三百户增至数千户。一时间，“汤青天”的美名家喻户晓，妇孺尽知。

就任江西道后，汤斌奖励耕织，舒缓民困；加强治安，保护民生；整顿衙门，清除刁顽胥吏。伏匪首，安民众，对抗清武装和山林盗贼采取以抚为主，剿抚并用的方略。不数月，就擒获了降而复叛的抗清首领李玉廷，解散了他的部队；平息了许多股出没不定的草莽英雄，使得强人卖刀卖犊，洗心向化。

在江宁巡抚任上，是汤斌一生从政生涯的顶峰。当时江苏号称天下富饶，但民风奢华，再加上前任巡抚余国柱疏于政事，上下吏治败坏，这里被称作难治之省。汤斌在任二年多，崇尚程朱理学思想，以此施政化民。他下令各州县普遍设立社学，讲孝经、小学等书籍，整饬民风，严禁妇女着奇装异服等有伤风化的行为。他毁禁刻淫词小说的书坊，取消火葬及水葬，大力推行土葬，“令下，一年报葬三万余棺”。他还屡次上疏免民赋税，及时救赈，重农事以兴本业。整修泰伯祠、范公祠等先贤祠宇，宏扬前代先哲正大光明的精神。他在察访中了解到，苏州城西上方山的五通神祠是一座花天酒地、乌烟瘴气的淫祠，以非凡的魄力拆除这座已有数百年历史的淫祠，这在当时是了不起的壮举，真正做到了移风易俗。随后，汤斌又下令各州、县将所有类似的祠庙全部毁掉，用拆下来的砖木材料去修建学宫。

汤斌一生以学问治天下、以学问辨是非、以学问教后辈。他从1660年归家丁忧起，近二十年间无闻于宦海，而是沉心于做学问。他著有《潜庵语录》《潜庵文钞》《春秋增注》等十几部书，死后被门人整理为《汤子遗书》十卷。

他的名作《桃花源》诗，以“能使此心无魏晋，寰中处处是桃源”的境界，得到读者赞赏。

洛学是北宋理学家程颢、程颐创立的学派，是中国学术思想史上理学的奠基石，影响深远。汤斌的《洛学编》作为一部梳理洛学师承的学术传记，是在清初编修学术史蔚然成风的背景下，奉师孙奇逢之命编修而成，前编断自两汉，正编断自程子。记述了中州学派自汉迄明的源流演变，旨在“表前贤以励后进”，使洛学传承之统得以复续。《洛学编》成书之后，历经八次刊刻印行，影响范围较为广泛。在编纂体例上，《洛学编》属方域范围内的理学史，为论学而作，虽以宋儒为主，而不废汉唐儒者之所长，在宋明诸儒的《正编》之前，又为汉唐经学大师特列《前编》，以揭示经学与理学之间的关系。《正编》之中汤斌打破门户之见，“笃守程朱，亦不薄陆王”，以记述程朱派理学家为主，而又兼顾陆王派理学家，主张“朱王合一，返归本旨”，淡化了学者们的理学宗派意识，从而避免学派偏见所带来的学术弊端。《洛学编》通过为不同时期的理学家修史立传，来严斥朱学的末流和王学的末流。从文中还可以看出汤斌反对讲学空谈，力求笃行实践，以及“主敬”、“存天理”等学术思想。在史料来源上，《洛学编》对所收录人物事实俱本原传，间取门人纪述。以阐述人物的学术成就为主，对于功绩繁重者，亦不备载。《洛学编》篇幅不大，仅四万余字，却是研究汤斌理学思想和中州理学发展状况的一部重要学术史著作。

在当时特定的思想风潮背景之下，汤斌的理学思想因王学的流弊而调整，中正平实，矫而不过，具有强烈的务实求用的特征，反映了明末清初理学思想的主要发展方向和鲜明特征，具有时代精神和意识。

史观方面，汤斌极力推荐陈寿，以《三国志》为楷模，做到尽去繁枝，独存劲干，颇为实用。他一生三入史局修撰《明史》、两任《明史》总裁，写下数十万字的明史稿。《明史》修撰历经顺治、康熙、雍正、乾隆四朝，前后共分三期。汤斌本着尊重史实的原则上书皇帝，要求把明朝的抗清忠义之士编入史册，这在当时是冒极大风险的，为此遭到诸多大臣攻击。但顺治帝非常赞赏汤斌的观点，才使其没有遭受文字狱的迫害。汤斌呕心沥血，于康熙十八年（1679年）至康熙二十五年（1686年）写出并改削《明史》天文志、历志12卷，列传35卷。二十五年以后所撰史稿书札不载，难以记数。今天保留下来的尚有太祖本纪4卷、后妃传1卷、历志3卷、列传12卷，共约二十卷，40余万字。由于汤斌等人的努力，使《明史》成为史学界公认的修撰得比较好的一部史书。汤斌还修撰有《睢州志》五卷。

此外，汤斌善画山水，工笔、写意均擅长，笔墨清丽健劲，一丝不苟。

南昌某人一天偶尔经过京城延寿寺街，看见书铺中有一个少年用几枚钱买了一本《吕氏春秋》，恰巧有一枚钱落在地上，某人暗中用脚踏在钱上，等少年走后就俯身拾起这枚钱。旁边坐着一位老翁，盯着看了很久，忽然起身问了某人的姓氏大名后，冷冷地笑一声离去。 后来，这个昧心“俯拾”一枚钱的某人，以监生的身份进入誊录馆任职，赴吏部应选得到江苏常熟县县尉的官职。他欣喜万分，整装赴任之际，到巡抚衙门投书请求谒见上司汤斌。当时汤斌正任江苏巡抚，结果某人“十谒不得见”，请求十次也得不到一次接见的机会。某人正在纳闷儿，欲问根由，只见门卫传达汤斌的命令说：“你不必前去赴任，你的名字已经写进弹劾的奏章了。”某人问：“大人弹劾我什么罪？”回答：“贪钱。”某人自己思忖：“我尚未赴任，怎么会有赃证？一定是弄错了。”急忙请求当面陈述。门卫进去禀报后，又出来传达汤斌的命令：“你不记得从前书铺中的事了吗？当秀才时尚且爱一钱如命，今天侥幸当上地方官，能不探囊月去箧（偷窃），为纱帽下之劫贼乎？（能不绞尽脑汁贪污盗窃，成为一名戴乌纱帽的强盗吗？）请马上解下官印离开，不要使当地老百姓因为你的贪污盗窃而受苦痛哭。”听了这番话，某人才想起以前在书铺中叩问姓名的老翁，就是这位巡抚大人汤斌，于是满面羞愧地弃官而去。

“豆腐汤”的由来汤斌从进入仕途之日起，一直克己省身，依靠俸银作为全家生活的来源。清代的官秩最高级别为正一品，年俸也不过一百八十两 （ 京官依例支双俸，正俸每一两还可支米一斛，约十四公斤 ） ，对于千里做官不为财的清官来说，只有国家发给的这些薪水收入，他们所过生活必定是清苦的。早在顺治年间，汤斌在陕西潼关道和江西岭北道任职时，几乎不沾荤腥，每日三餐都以豆腐汤为菜，生活非常简朴，在当地口碑很好，岭北道的驻地赣州曾有人送给他“三汤道台”的称号，赞扬他为官清廉。 康熙时，汤斌由内阁学士出任江苏巡抚，职重位显，独当一面，但他不谋私利、不图享受，坚持过粗茶淡饭的俭朴生活，还是餐餐都有一道豆腐做的菜，久而久之，苏州老百姓又给他起了一个“豆腐汤”的雅号。

汤巡抚不仅自己苦，家人亦随其苦，其妻马夫人一转身竟有棉絮自袄边散落；有一天，他检查出入帐簿，发现其中有一天买了鸡，便问从仆：“这是谁买的鸡？”问明是长子汤溥所为后大怒，立即命令从仆把汤溥叫来，令其跪在庭下，斥责道：“你以为江苏鸡价如河南老家那样的便宜吗？你想吃鸡，就回老家去。没有读书人不吃菜根而能自立的。”对于买鸡的仆人也处以杖责。

在京城，人称汤斌为“羊裘尚书”，因为冬天上朝时汤尚书总是外披一件羊皮袄。（已34岁）所为后，谓“哪有读书人不能咬得菜根而可以成大事的”，即令其子跪诵《朱子家训》，后撵回老家睢州。在京城，人称汤尚书为“羊裘尚书”，因为冬天上朝时汤尚书总是外披一件羊皮袄。

清初，苏松两府富甲天下，在那里做官的，未满三年就自我离任，盖上司知是肥缺，经常向下属逼贿，以至因挪用库金而进狱者多多。

汤斌在家读书二十年，又长期做地方官，深知其中积弊，积重难返。于是在刚出任江苏巡抚时，就向所属的道、府、县等地方官先打招呼，以免日后言之不预。他说：“你们挪用库金讨好上司，无非是为了做官嘛，现今为拖欠所牵累，那还有什么希望呢!我愿和你们相约，日后能够称职，我自然会提拔你们；要是做不到，以考成后顺利归家，太太平平地回乡，也不很好嘛?!”他还告诫所属官员，切切不得受下属贿赂。汤斌办事，令出期于必行，致使苏州大治。

关于汤斌之死，野史中有更详细的记载。明珠当权时陷害汤斌，外间传闻康熙要把汤斌家产充公内务府，汤斌听说后非常惶恐，上疏请求致仕，不被允许，又席蒿待罪，每次宣旨一到，就磕头流涕请死，不久后迁为工部尚书，赴通州勘察楠木，一天他突然返回，招来某位同乡官员说话。官员离开后，汤斌独处一室，对家人说：“吾体不宁。”夜半的时候，家人就发现他已死去了。

汤斌死后，葬在宁陵县黄岗乡己吾城村村南，至今尚有坟丘尚存，略显凄凉。这个家族墓地，埋葬着汤斌和他的四个儿子、一个侄子。而位于睢县城内解放路西段的汤斌祠（实际上是汤斌为其母亲兴建的祠堂，因为汤斌的名声更大，后人乐于误传之。该祠堂殿房宏大，由此观之似乎汤斌也并不是穷得“连买棺材的钱都没有”），是省级文物保护单位，睢县著名的文物旅游景点。