沈懋学曾跟从阳明后学王畿学习。后值张居正父丧夺情，与吴中行、赵用贤谋各上书。中行、用贤皆受杖去国，而懋学疏为人所持不果进，乃贻居正子嗣修书；又与工部尚书李幼滋书以争之。幼滋复书谓懋学所言为宋人腐语，居正不奔丧，得圣贤中道。懋学遂引疾归。卒，追谥文节。