沼沫花科的学名Limnanthaceae由模式属沼沫花属学名Limnanthes的复合形式Limnanth-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“沼沫花属”中的专名“沼沫花”加上“科”字构成。其单纯的中文别名有池花科、假人鱼草科、沼花科、沼泽草科等，详见沼沫花属条目的“词源”一节。