在台湾清领时期，大量迁移至台湾的该三县居民，是泉州府移民的主要成分，占40.84%。台南、彰化分别为三邑人蔚集的最大、次大地区，也验证了台湾由南而中至北的开发次序。在台湾地区，如新竹、彰化、云林、台南、屏东等地，三邑移民在该些地区的漳泉十二县人当中之比例高于台湾的平均值。

在台北，三邑移民以艋舺龙山寺为中心，颇得商利，为了商利，也参与、引发了许多历史重要事件，如驱逐势力范围内的同安人之顶下郊拼等。

通常来说，泉州三邑的建筑，宗教，以及生活习惯影响台湾甚巨，比方庙宇建筑，台湾丧葬习俗，语言腔调等，如台北的艋舺青山王庙、艋舺龙山寺，都是泉州三邑人的信仰中心。

根据两岸的谱牒、明清墓葬资料，旧时迁台的福建泉州府三邑诸姓如下：陈、蔡、吴、王、黄、林、张、许、李、洪、谢、郑、苏、曾、庄、杨、柯、颜、施、周、郭、叶、吕、刘、萧、姚、孙、侯、赵、傅、卢、朱、徐、高、何、翁、赖、邱、戴、卓、梁、蓝、连、马、沈、辜、江、方、留、粘、褚、巫、纪、石、廖、詹、阮、丁、伍、尤、雷、童、康、柳、彭、胡、韦、宋、余、曹、涂、范、鄞、蒋、穆、佘、倪、袁、龚、程、薛、金、田、罗、唐、车、董、万、杜、世、汤、邓、白、潘、钱、钟、章、花、阙、邵、汪、任、骆、辛、出、欧阳，多达106姓，晋江最多、南安次之、惠安最少。