法主公故事因为各地百姓口传，版本略有不同，较为流行的故事情节梗概如下：

传说中，法主公张慈观，与萧朗瑞、章朗庆二真人，义结金兰，三兄弟于闾山许逊真君宫殿中修炼，受赐风火轮；又习太乙天尊法术，均善道法。

张真人也修佛法，一次至南海普陀山拜山，观音大士曾赐张真人柳枝，真人一拿，即化为宝剑，返回途中，于龙王宫前遇龙树菩萨，龙树菩萨传之以空法，并以经书装在锦囊内，赠予张真人，真人开锦囊，取经欲读，手上锦囊即化作能装鬼神的“乾坤囊”，张真人甚感激两菩萨的传授，也立志为佛门护法。

张慈观真人得太乙天尊、旌阳祖师之道法，精于法术，在福建修炼。修炼时遥见妖怪“五通”（“五通”是妖怪的习称，数目或是种类皆不一定。）强娶民女。张真人为救无辜少女，遂驾着风火轮飞到，用隐身法把少女救出，自己化身成新娘，趁妖怪不注意时拔剑杀出。

这时，“五通”抵挡不住，要求放掉武器，空手对仗。真人允之，将宝剑插在地上，一跺脚步，足迹入石一尺三寸。“五通”遂效法之，足迹只入石一寸，种种迹象，足证真人法力较高，五通拔腿就跑。真人追赶“五通”，一步步地走上矗立的石壁，石壁形成宽八寸、深一尺三寸的石沟，留下四十五个脚印。“五通”见状大惊，知道真人法力不凡，于是打算智取。

“五通”拚命奔跑，将真人引入石壶洞中，“五通”奔出，塞住洞口，点起阴火焚烧，欲将真人烧死。真人禁锢于洞，听到洞外“五通”与群魔在狂欢庆贺，分食红龟粿（一种乌龟形象的点心，内馅多为甜豆沙，多为祭祀神明、节日时的应景食物），真人饥肠辘辘，无力作法，遂喃喃自语：“火烟熏不死我，就怕被红龟粿粘到身上，必然丧命。”“五通”信以为真，就把红龟粿全部丢进洞内，想粘死真人。真人遂大得于红龟粿，饱餐一顿后，念起真言，请出萧、章两个结义兄弟前来助战。萧真人、章真人一至，大杀鬼卒，打破洞口。张真人遂出洞，又与五通大斗法一次。故中国民间传说，祭祀法主公最好的供品，就是红龟粿。

真人法力较高，本欲将“五通”杀之。但一想“苍天有好生之德，此怪修炼有年，法力不低，不如收为护法神。”，于是打算计降之，向“五通”提出和解，并请“五通”食狗肉。“五通”法力不济，本知必败，见到能和解，立刻欣然应允。于是，夜半两人在洞门口共食。真人一块狗肉也没有吃，只吃囊中带着的黑豆，口中响声不断。“五通”遂问：“君口中嘎吱作响，何故也？”真人答：“汝运好，挟到肉，我挟到的只有骨头，所以口中作响。”天明，五通犯了荤菜不食狗肉的禁忌，法力全失。于是张真人把“五通”打回原形，原来“五通”是螃蟹精，真人令其悔悟，并收之为护法神将。

张慈观真人得知福建旱灾，民生艰苦，颇动悲心，飞身潜入天庭，发现闽人注定有劫，故不降雨。于是将玉帝洗笔之水倒下福建，遂黑雨遍降，消解旱灾，且因黑雨为天上仙水，故农作物长得极快，几近一日长成。

玉帝法眼一观，发现是张真人，遂命雷神持天书逮捕张真人治罪；雷神动起雷光寻找张真人，张真人灵机一动，化身作监察神“御史真君”，手持乾坤囊至，考察雷神，问雷神办事可有天书玉旨。雷神忠厚，遂将天书与之。御史开天书一览，说：“天书诏曰：遣张慈观擒拿雷神问审，尔其钦哉。”雷神大惊，谓是天庭将天书写错。御史说：“君且在我囊中休息，我为君向玉皇天尊请示，以免误事。”雷神感谢，于是入袋。慈观真人向袋口细细叮咛：“君且莫出声。”雷神听成“君且出声。”于是不断鸣雷，一时间天庭震动。

因天上连连巨响，众仙震怒，于是要找出雷神，此时张慈观真人遂答禀雷神在自己手上，并将自己为何要违犯天条之理由禀告玉帝。玉帝甚感张真人诚实之意、爱民之心，不但赦免其罪，还封张为“监雷御史法主真君”，以监督雷神。

张真人三人结义，一曰“萧真人”，另一曰“章真人”（或曰姓洪）。三位真人得到闾山法术，法力高深、武艺精通。三人修道之时，听说永春九龙潭石牛洞有一条千年赤色蛇仙为害地方，动辄作祟，使得水灾、旱灾不断，并且要求人民以活人献祭，张真人兄弟闻而大怒。

三人驾风火轮入洞，洞中毒水弥漫，不见大蛇，其实大蛇藏于洞中密处，已知来意，猛然吐信直取张真人，张真人飞腾而起，手持宝剑勒住蛇头，怪蛇突喷黑烟，张真人顿时变为黑面。萧真人怒甚，满脸赤红，抡起月眉斧，猛砍蛇身，在怪蛇挣扎中，误伤了章真人额头，在章真人额上留下一道刀疤，更为紧张，脸色遂更红，（或曰章真人焦急而脸色转青）。终于制服此蛇，张真人念动真言，将蛇缠绕于手上而离去。

三人制服蛇妖之后，功成行满，即有仙乐飘飘，香花朵朵降下，三人即踏彩云登天。也因此法主真君三兄弟，张真人为黑面，萧真人红面、章真人青面，额部有一条刀痕。

张真人成道以后，在安溪、永春、福州都享香火。一次，瘟神到永春行瘟，一时病人甚多。张真人遂与该瘟神打赌，若输，可将庙宇让给瘟神，否则请瘟神离去，瘟神允诺。

于是两神相斗七昼夜，僵持不下，瘟神于是在庙门设幕府，动起干戈，部将诸军包围真人之庙，阴风阵阵，夜半刀兵之声不绝。张真人有监雷之权，早将雷神、五营六甲神兵埋伏于庙，以俟后变；此时真人跃登法坛，动起雷法，雷神等一气冲出，将瘟神部队围住。

瘟神知道张真人法力甚高，又具谋略，遂告知真人：“吾代天巡狩，意在难‘在劫之人’，今此乡在劫之人几尽；君当入武夷山采药，重者仍不可治，轻者可存。”真人知道瘟神亦奉天命，来收劫数中人的性命，不得不为，遂赠之以酒食纸钱，送之离去。

瘟神既离，真人遂入山，访武夷真君，采草药与众人服食，病者逐渐痊愈。从此，永春人除瘟疫都奉祀法主公，而非沿海人除瘟疫的王爷信仰。

泉州有某尊王信徒，时常迎接其神明神像在各地展开庙会，四处对乡民派敛香火钱，永春州人颇苦之，唯不敢言。法主圣君一日降乩曰：“岂为真虔，莫非要钱？若恨垂涎，庙金换铅。”意思是将法主公庙弄得破破旧旧，避免神棍垂涎。信徒依照此言行动，神棍队伍一至永春法主公庙，发现法主公庙变得十分破旧，觉得怪异，因而询问。庙方回应“近来永春灾荒，人民困窘，才会连法主公庙都这么穷困。”神棍只好将神明銮驾返回，徒费银钱数万。

清时，有道人自言奉罗祖教，能呼风唤雨之术，在泉州劝众捐资，以便老母收圆，时颇惑众，有民卖妻子田产以随之者，道人遂殷富，鱼肉乡里，甚至威逼店家纳香火钱，否则聚徒众闹事，一日舆过法主真君庙，忽见一巨蟒急祟出，轿夫大惊，轿坠地，道士仆倒，怀里银钱四散，蛇即不见。道人怒曰：“庙有邪鬼害我”，仗剑入庙，庙中有声，厉曰：“老母何在？”，道人手、足竟自起火燃烧，滚地，庙内香客助以灭火，火灭时，道人已疯癫矣。

台湾的闾山派分为两支，闽南语俗谓“死归法主，生派夫人”。

一支将法术高强的法主公奉为祖师，并以黑头巾作为派系之标记，以丧礼法事、超渡驱邪等见长，人称“法主公派”，台湾人称之为“乌头法师”，亦称“乌头派”。

另一支，奉临水夫人等三位女神为祖师，以红头巾作为标记，称作“三奶派”，又称“红头法师”，专作节日、庙宇做醮等法事。

法主公信仰于福建的福州、永泰、仙游、德化、永春、安溪等县颇为盛行，而安溪之茶叶商人信奉尤诚，安溪许多茶商将法主公与清水祖师并列，视为重要之保护神。

17世纪后，渡台的安溪茶商，将法主公香火带入台北，法主公信仰，遂成为流行的台湾民间信仰之一。此信仰尤其流行于安溪族群聚集处，其中以台北法主公庙最为著名。