直至1800年，波图格萨北山羊的数量丰富，但其后因猎杀而急速下降。它们于5月时份会走到较低海拔的地方，这正是猎人捕杀它们的时机。它们的肉可供食用，胃粪石是有效的解毒剂。毛皮可以制作为披肩，角则可以用来装饰及制作成号角。1870年前，它们很稀有。最后纪录的群落是于1886年发现。一头雌羊于1889年被捕获，但却只生存了三天。翌年发现两头因雪崩而死了的雌羊。最后已知的波图格萨北山羊是于1890年在西班牙死亡，不过于1892年有指在葡萄牙见到一头雌羊。现时另一个亚种Capra pyrenaica victoriae被引入它们以往的分布地。在伦敦曾存放着一个标本，但却于1978年的大火中烧毁。