韩非以韩王名义收留的百越难民在一夜间全部离奇惨死。韩非、张良来到现场调查，分析是百越人所为。

百越难民之死和先前的新郑大火，实际都是血衣侯白亦非从狱中放出的百越废太子天泽所为。“赤眉君”天泽被囚禁在韩国多年，如今重获自由，召回“百毒王”“驱尸魔”“焰灵姬”“无双鬼”四名部下，一心向韩国复仇，并绑架了韩国太子。韩王大为震怒，命令韩宇、韩非、姬无夜、张开地尽早想出对策。姬无夜心怀叵测，韩宇亦同样由自己的心机。最后救出太子的重任落在了韩非头上，韩宇只派出义子韩千乘来协助救援，姬无夜则派出大队士兵和高手墨鸦来“帮助”韩非。

太子府中，卫庄、墨鸦出手后，与紫女在通往王宫的必经之路上阻击天泽和驱尸魔。天泽猛烈反击而让韩非处于危险中，幸亏逆鳞剑化身将天泽带进另一个空间打得天泽蛊术发作。后来卫庄赶到并与紫女合力逼退天泽和驱尸魔，但天泽离开时抓走了红莲公主。韩非与张良密会天泽，但韩非的筹码只能换回红莲、太子一人，韩非表示救出太子并直言不会放弃红莲。最终，太子仍离奇遇害，韩非通知白亦非前去抓捕天泽，卫庄则趁乱救出红莲。

张开地奉命于韩国城郊迎接秦国使臣，不料天泽突然出现，秦国使臣被刺杀身亡。秦国于是派大军压境，重新派出使臣出使韩国。韩非调查秦国使臣被刺杀一案，正与张良谈论案情，秦国新任使臣来到，竟然是韩非昔日同窗——李斯。韩非与李斯正面交锋，并巧设赌局对弈李斯，暗示李斯放弃吕不韦转而向秦王嬴政效忠。卫庄向韩非引见了自己的师兄盖聂，韩非用自己的才能说服了盖聂，也得到了和秦王嬴政见面的资格。

韩非指出了秦王的心事，秦王也指出韩国危在旦夕，韩非也腹背受敌。韩非却只要秦王赦免一个人。就在这时姬无夜率军而来。韩非设计让秦王脱身。

十日期限已到第五日，王宫中李斯咄咄逼人，韩非一石四鸟把焰灵姬当做刺杀秦国使臣的凶手化解了两国干戈。与此同时秦国顶级杀手团体——“八玲珑”已经尾随秦王来到新郑，伺机将其暗杀，姬无夜的夜幕也为八玲珑的刺杀提供便利。韩非等人设下巧计让秦王平安脱身由卫庄护送到紫兰轩藏身，还联合百越周旋于夜幕，罗网之间，得到秦王的高度评价。

八玲珑的本体玄翦来到紫兰轩，在与张良对峙过程中被唤醒了记忆，与卫庄交手并且将他砍伤，但因百越的焰灵姬中途出现而打断。白亦非也来到紫兰轩对付焰灵姬和卫庄。天泽也来到了紫兰轩，并从白亦非手中救下了被冰封的驱尸魔，随后和白亦非进行正面交锋，但被白亦非再一次压制。盖聂以飞剑攻击紫兰轩的顶梁柱使房屋崩塌，天泽在百毒王的牺牲掩护下带着驱尸魔和焰灵姬撤离。紫兰轩陷入一片火海之中，紫女为姐妹的牺牲与现状的担心落下一滴眼泪，韩非则表示一定会还她一个更好的紫兰轩。

天泽在逃离韩军追击后与韩非在郑国旧王宫会面，在韩非的劝说下决定与流沙联手对抗共同的敌人夜幕，而焰灵姬则暂时留在韩非身边作为双方合作的纽带。

之后，流沙四人展开讨论了卫庄、盖聂与玄翦的过往，得出结论玄翦的归来会比过去更加强大。四人来到紫兰轩的废墟前，总结此次护送嬴政的事件，韩非提出流沙应该要做出改变。众人回到韩府，韩非表示如今最需要的是钱，其余人都各自掏出部分钱财，最后紫女拿出了自己的巨额积蓄——紫兰轩的经营存款。

南阳突发旱灾，事关立储王位，夜幕意图控制韩国命脉。韩非自请赈灾，亲临灾区实地考察，在卫庄和紫女安插的“九义会”配合下，发现四凶将之一的翡翠虎，在南阳买卖人口，垄断肥料，并且在肥料中混入生石灰，烧死庄稼人为制造旱灾。同时翡翠虎炒作哄抬粮价，以购买军粮为名，购空韩国市面上流通的粮食，断绝用于赈灾的资源。

在韩府，紫女像韩非介绍过去三年翡翠虎强大的致富手段。而红莲则扮作宫女闯入流沙会议，强烈要求自己加入流沙并为自己代号为“赤练”，紫女听后将自己的佩剑赤练给卫庄让其赠与红莲，并提醒卫庄教红莲剑术，同时提出红莲可以在宫中调查潮女妖。

韩非下朝后与流沙三人讨论朝局，紫女在夜幕安插的眼线传来消息——韩王下朝后讨论立储事宜。四人继续就韩王态度讨论，紫女表示韩王立储此举并不意味着想要放权，而是为了试探。紫女与韩非、张良一起查阅南阳的资料，并接手负责流沙的经营。

韩非无法通过正常渠道赈灾，只能再次登门拜访翡翠虎，以一千金为赌注，与翡翠虎打赌粮价会降，翡翠虎提出一赔十以一万金回赌，后双方又各自追加翻倍，并以“铁血盟”做担保。韩非带着红莲去魏国找乐灵太后高价买粮，挫败了翡翠虎收购魏国粮食的阴谋，兄妹合作博得太后赞赏。韩非设巧计疑兵，让焰灵姬成功运回粮食，夜幕为置韩非于死地，烧毁了流沙筹集的赈灾粮。韩非与卫庄铤而走险劫走夜幕军粮，翡翠虎误判韩非走投无路，进一步哄抬粮价到峰值。

韩非在赌注最后一天大量抛售粮食，引起粮价下跌，翡翠虎因贪心不及收手，输掉赌注，失去全部总计两万金家财和前期过万金的购粮款。夜幕把韩非告上朝堂，韩非针锋相对为自己辩解，在张良配合下，揭发翡翠虎私藏军粮的罪行，用于南阳赈灾和调控粮价的粮食并非军粮，而是依法征收的私藏粮，流沙最终妥善的解决了南阳的旱灾，翡翠虎则被血衣侯灭口。

弄玉为了刺杀姬无夜，决定牺牲自己，以宫女的身份成为姬无夜新的猎物，被关在了雀阁。夜幕杀手白凤偷琴送给弄玉，弄玉弹出引百鸟来朝的旷世乐曲，却引起了姬无夜的注意力。姬无夜命令杀手墨鸦杀死白凤，墨鸦出手控制住白凤，但在听了白凤心声后还是放走了他，二人开始逃亡之路。白凤返回将军府潜入雀阁要带弄玉一起离开遭拒。白凤并没有离开，而是留了下来。

墨鸦发现了弄玉身怀红莲公主授予刺杀任务的秘密，让其放弃却被拒绝。然而弄玉刺杀姬无夜失败，便服毒。此时白凤与墨鸦先后出手相救，三个人却被姬无夜关在了充满机关的牢笼里。又经过一番激烈交战后，墨鸦用智谋和生命找到了一条生路，而白凤则成功带着弄玉逃离了将军府。

白凤带弄玉逃出城外去找寻解药，但无药可解。弄玉临死前将小白鸟托付于白凤照顾并在白凤手心再次弹奏心弦之曲，寓意白凤终将凤凰涅槃，浴火重生。

红莲出现，并对弄玉的死表示哀伤。白凤因为弄玉之死迁怒于红莲，正想上前报仇时，卫庄、紫女相继出现，卫庄轻易制服白凤，紫女称姬无夜受了重伤，正在全城搜捕白凤。卫庄则表示白凤还不够强。

三年后，姬无夜决定强娶红莲。韩王安将红莲当做奖品赏赐给姬无夜。出嫁那天，红莲在花轿外看见了卫庄，于是下定决心刺杀姬无夜。新婚之夜，红莲刺杀姬无夜失败，性命垂危之际，卫庄出现并将姬无夜杀死。

后来，韩王安被卫庄所杀，面对卫庄给她的两个选择，红莲毫不犹豫的选择追随卫庄。她将从前的自己彻底颠覆，浴火重生，并正式加入流沙，更名“赤练”，成为一名杀手。

数年后，韩非出使秦国，其学说集法家之大成，本被秦王政所赏识，却遭同门秦相李斯陷害而入狱，最终客死他乡；张良在韩国灭亡之后，远遁齐鲁之地，拜入韩非的恩师荀子之门，成为儒家的杰出人物，赫赫有名的“齐鲁三杰”之一；卫庄则接管了流沙，一直在暗中调查韩非的死因。他将原夜幕杀手白凤、来自百越组织的无双鬼，以及苍狼王、隐蝠、黑麒麟等杀手收入麾下，将流沙变为职业杀手团，受雇于人执行无差别暗杀工作，在七国之内恶名远扬，令人闻风丧胆。

卫庄率流沙组织发动旧都叛乱时，与楚昌平君、农家神农堂朱家有过反秦合作与交易。荆轲刺秦前，阴阳家的焱妃对六指黑侠施下六魂恐咒。在六指黑侠咒发身亡前，焱妃又找来卫庄寻求合作，让卫庄将六指黑侠打伤。因此世人皆将六指黑侠之死视为“流沙”所为，却不知此事与阴阳家的关系。

盖聂出人意料地叛逃秦国，携故人荆轲之子荆天明亡命天涯。李斯便以盖聂作饵，诱卫庄出山捉拿逃跑的盖聂与天明。卫庄召集“流沙”四天王，先命流沙中的韩国力士无双鬼探查情况，结果无双鬼被重伤的盖聂及时击杀。卫庄赶到时，立刻从断掉的树叶中判断盖聂受伤，并查出盖聂动向。他之后又先后派出苍狼王、赤练、白凤凰追杀盖聂等人。盖聂、天明和同行的墨家人最终有惊无险的逃入墨家机关城，但通过白凤传达的消息，卫庄也找到了机关城的入口。

李斯通知卫庄公输家族已经出动，卫庄便命流沙中的隐蝠和黑麒麟前往机关城。

隐蝠与大铁锤对决，要将大铁锤杀死时却不敌高渐离与雪女的“阳春白雪”，被击退。而黑麒麟则扮作墨家弟子成功打入墨家机关城，为流沙传递信息。

卫庄统领下的秦兵想要攻入机关城，却被城外密布的陷阱、机关阻碍。公输家族掌门公输仇前来参与围剿墨家的行动，以机关蛇逼退了墨家的机关白虎，并与卫庄商议攻占墨家机关城的办法。卫庄通过黑麒麟得到了机关城的设计图，公输仇借此分析出了机关城的弱点——水源。卫庄于是让黑麒麟将赤炼所作的毒药“鸩羽千夜”投入中央水池。随着第二日毒性发作，墨家战斗力遭到重创，流沙与秦军趁乱而入。

在机关城中，墨家统领高渐离一击击杀苍狼王。卫庄却突然出现，与高渐离交手，使高渐离处于劣势。高渐离与墨家其他成员逃入机关城的枢纽“墨核”，凭借墨家机关进行抵御，使秦军一时间无法攻下中央大厅。公输仇将改造完的机关无双献给卫庄，与此同时，端木蓉被隐蝠控制，抓到了中央大厅。卫庄以墨家弟子与端木蓉作人质要挟密室中人，局势陷入僵持状态。在卫庄将要杀害端木蓉的紧要关头，盖聂及时赶到，与卫庄展开决战。然而白凤却突然出现。端木蓉为了保护盖聂而挡下白凤的重击，重伤昏迷。端木蓉此举深深震撼了盖聂，也燃起了他更加炽烈的怒意。二人再度交战。黑麒麟易容成天明，偷袭盖聂得手后露出了真面目。盖聂要杀黑麒麟，被卫庄拦下，黑麒麟得以安全撤退，盖聂和卫庄再次展开激烈的决斗。

盖聂的渊虹被鲨齿折断，但盖聂仍用断剑制服了卫庄。然而盖聂因犹豫不决而被卫庄抓住机会一剑反击，击晕在地。卫庄并没有杀死盖聂，他心里也期待着与盖聂公平一战。机关城大厅内，天明赶来豪言不会放过卫庄，激动之余，阴阳咒印隐隐要发作。赤练趁机对天明使用火魅术挑拨离间，令他将矛头指向墨家众人。卫庄捉住天明作为游戏筹码，双方一对一对决，最终打成平手。墨家巨子与逍遥子、张良等各路英雄豪杰前往机关城，挡住了隐蝠对盗跖的攻击，并轻松重创隐蝠。而天明与卫庄这一战无法躲避，巨子只能临时传授天明非攻秘技，天明一知半解地以新学的招式向卫庄攻去，非攻连环变出盾牌、御魂环等，最终发动逆鲨齿形态，居然夹住了鲨齿的利齿，封住了卫庄势不可挡的一招。

墨家巨子揭露了自己真实身份——燕太子丹。当年燕亡时，卫庄轻而易举地“杀死”逃亡的燕丹，但事实是燕丹为隐藏自己的身份而故意承受他一剑。燕丹用墨眉打败了已经重伤的卫庄，并放过卫庄，让卫庄带着流沙组织离开墨家机关城。卫庄带领“流沙”离开机关城，前往桑海，对已经残废的机关无双则选择置之不理。

张良和卫庄两人秘密会面被“罗网”的暗探监视，被白凤发现解决。

会面结束的卫庄一行人在一座木桥上与背负“巨阙”的亡命囚犯胜七擦肩而过，赤练建议除掉他，卫庄不置可否。胜七和卫庄在木桥上进行了一次惊心动魄的比试，卫庄由于身上有伤，不愿恋战，借巨阙上撩之力逃走并失踪。赤练坚定寻找卫庄，教训了企图逃避的隐蝠，并假称对白凤下毒，逼白凤共同寻找卫庄，但在寻找过程中与白凤发生争执。随后，她独自一人时遇到胜七，向其询问卫庄的下落，最终激怒了胜七险遭杀害，生命垂危之际被突然出现的白凤救走，与白凤继续寻找卫庄。

卫庄后在山里某处醒来，遇到一位神秘人，神秘人声称他能为卫庄提供有价值的情报。白凤从将军府回来的路上，意外发现了身披黑斗篷的卫庄身影。当天深夜，卫庄突然出现在李斯的府上，询问胜七的信息以及韩非的死因，并且卫庄告诉李斯，韩非实因中“六魂恐咒”而死，并警告李斯“流沙”对他的行动了如指掌。

卫庄回到了流沙，并带领流沙现身墨家逃亡的路上，与墨家众人对峙。

在张良从利、义两角度的同时劝说下，流沙与以墨家为首的反秦势力形成暂时的利益合作关系。同时，在墨家机关城之战后被卫庄抛弃的机关无双，也在张良的帮助下回归流沙。

为查探失踪的墨家统领庖丁的下落，墨家统领盗跖故意被秦国“影密卫”头领章邯活捉，押入噬牙狱。张良请求卫庄通过与盖聂一同前往噬牙狱营救盗跖、庖丁，来分散秦国对儒家小圣贤庄的注意力。赤练担心卫庄会因回忆起自己曾经在狱中受刑之事而痛苦，正欲替卫庄拒绝，但卫庄毫不犹豫地答应了张良。

盖聂与卫庄成功潜入噬牙狱，并先后救出两人。章邯运用一系列的机关试图拦截众人，但众人用智慧转危为安。四人最后逃亡回到盗跖最初被关押的地方，意外地发现了逃生的密道，却在准备逃出时被“罗网”组织“六剑奴”及章邯率领的“影密卫”的包围。“六剑奴”与盖聂、卫庄展开激战，原本占据上风，令二人负伤。但二人后使出“百步飞剑”（木剑）和“横贯八方”的合击，将“六剑奴”逼退，并使“六剑奴”亦受了不轻的伤。夺得上风的二人无心恋战，趁机成功逃出“六剑奴”和“影密卫”的包围，唯有章邯穷追不舍。最终，按赤练的提示和请求，墨家统领班大师驾驶机关玄武从海底接应四人。负伤的章邯被迫逃回噬牙狱。

得到章邯要去往东郡、神农令突然现世的消息后，流沙与墨家联盟决定兵分两路，高渐离与逍遥子、卫庄和盖聂各一组，分别前往东郡与农家据点，去的路上卫庄与盖聂谈论了有关秦始皇的事情。

盖聂与卫庄找到流沙以前的合作者——神农堂朱家，询问神农令为何人所发。被得知神农令的内容“先得到荧惑之石者当继任侠魁”，而发布者不止某人，而是一个上通帝国朝政，下通江湖之野的组织，觉察真相的盖聂与卫庄应“邀”前往烈山堂。烈山堂主田猛却抢在这之前蹊跷死亡，盖聂与卫庄遭人暗算。两人逃离烈山堂的包围圈，并回想起有关昌平君与韩国新郑暴乱之事。

卫庄与盖聂在农家劫镖地附近目睹农家各堂与帝国抢夺荧惑之石残片的过程，然后跟踪白屠并与惊鲵交手。章邯却前来质问惊鲵杀害影密卫的事情。章邯得知帝国内部奸细为罗网时，欲抓捕惊鲵协助调查，让纵横二人离开现场。盖聂与卫庄将被控制的白屠带到钟离眛面前审问。

韩信来看望钟离眛，并向三人传达高渐离、大铁锤与田虎交战的情报。卫庄与盖聂一起去追踪马车的痕迹，拦截押送高渐离、大铁锤二人的魁隗堂堂主田蜜一行，却被魁隗堂两千四百名弟子包围起来使出的地泽二十四困住，后被龙且与季布带领旧部解围。

为了应对罗网的阴谋，章邯决定联合鬼谷纵横。农家烈山堂堂主田言也前来以农墨两家关系为由，劝说墨家、道家人宗和纵横势力支持她当上侠魁。

纵横得到了韩信的情报，前往大泽山除掉了挟持田言的众杀手。为了拆穿田言的谎言，卫庄还将黑麒麟扮成已经死去的田猛的形象，田言的弟弟田赐吓得说出了田猛其实是被自己无意杀死的真相。鬼谷纵横抽丝剥茧地进行推理，种种迹象均指向一个真正的结论——指使田赐杀死田猛的惊鲵，其实正是农家烈山堂的堂主，田猛的女儿田言。

田言见事迹败露，便显出真身——罗网天字一等杀手惊鲵，便与卫庄展开交锋，察觉到了卫庄曾受过的重伤。田言与卫庄交手数十招后被击退。她劝阻纵横离开六贤冢，但被纵横拒绝后，田言称要在神农像头顶悬崖向纵横二位发起挑战。战斗过后，田言向纵横讲述了自己的过去，希望获得鬼谷纵横两人的信任。

纵横后在田言的建议下，前往醉梦楼，对抗要杀害章邯的掩日，并救出了章邯。而流沙的白凤凰与墨家的盗跖则前往蜃楼寻找天明、少羽等人。

与姬无夜的“夜幕”组织（由核心“四凶将”和杀手团“百鸟”组成）的风格类似，卫庄领导时期的“流沙”组织由“四天王”和擅长执行隐秘任务的分支小队“逆流沙”组成。“四天王”是组织的核心，而“逆流沙”专门负责一些难度超绝、极度隐秘的暗杀任务。

卫庄领导下的组织和多股势力相互利用过。荆轲刺秦计划实施前，阴阳家焱妃找来卫庄，将六指黑侠之死嫁祸给组织，使得组织名声进一步扩大；秦始皇统治时期，卫庄为打败师兄盖聂而带领组织与秦国（含公输家族）相互利用，使得秦国在一日之内便攻破了墨家机关城。但随着机关城的沦陷，组织与秦国的合作也宣告结束。

除了执行各种雇佣杀人工作之外，组织也一直在幕后暗查韩非死因。期间，卫庄在保持与潜龙堂老板司徒万里（同时为农家四岳堂堂主）合作的同时，也与楚昌平君、农家神农堂堂主朱家等有过反秦合作关系。机关城之战结束后数月，卫庄又在张良的劝说下，带领组织与以墨家为首、包括盖聂在内的反秦联盟暂时和解并达成利益合作关系，一致对抗秦国以及在很久之前就已经与“流沙”为敌的“罗网”组织。

“这些沙子，如此渺小无力，只能随风漂浮而身不由己，连自己都不知道下一刻会飘向何方。然而我一直觉得，即便是微不足道，即便外面的风云变幻都与它无关，它总还有存在的理由。也许这才是流沙真正的意义。”

成为嬴政的兵器，这好像并非是流沙创立的原意，“每个人都必须学会在这个新时代生存”，听起来更像是一个优雅的借口。

“替嬴政消灭墨家，难道是流沙正确的选择？”

“你们流沙曾经不是反抗嬴政的吗？怎么反倒成了他的走狗了？”

流沙作为一个为金钱出卖灵魂的杀手组织，永远不可能成为值得信赖的伙伴。与流沙合作，无异于与虎谋皮。

“所以，流沙的人一旦失去了利用价值，就会毫不犹豫的舍弃，就像你们对待机关无双那样！”