其母一般认为是长政的正室阿市，但阿市嫁到浅井家的年份众说纷纭，一般多认为是1567年，也有1564年说。但如果是采1567年说，万福丸则当是长政与侧室所生之子。不管其生母为何人，他都因为身为长政长子的关系，被认为是浅井家的继承人。

1573年，织田信长攻伐浅井与朝仓两家，灭朝仓家后，随即兵临小谷城。就在两军交战之际，有家臣带著万福丸从小谷城趁夜逃出。浅井家灭亡后，万福丸被织田军的羽柴秀吉捕获，送到关原处以磔刑（串刺之刑）而死，年仅十岁。