始设于顺治四年（1647），驻汉军，以固山额真领之；

十年设副都统左、右翼各一人；十五年改固山额真为昂邦章京，十七年改称总管；

康熙二年（1663） 更名杭州将军。

十三年增设汉军副都统二人。

雍正七年（1729）徙杭州右翼副都统驻乍浦，设驻防水师营。

乾隆十六年（1751）裁汉军副都统一人，二十八年复裁一人，尽裁驻汉军，留驻满洲、蒙古，遂定制。杭州驻防设将军一人，副都统一人，协领九人，佐领二十四人，防御二十人，骁骑校三十二人，八旗满洲、蒙古前锋二百人，领催、马甲四百八十人，鸟枪领催、马甲八百人，炮领催、炮甲一百九十人，步甲三百二十二人，养育兵一百二十八人，匠役九十六人，凡官兵二千三百余人。乍浦驻防设副都统一人领之，下设协领满洲四人、蒙古一人，佐领十六人，防御八人，骁骑校十六人，满洲、蒙古前锋二百人，领催、马甲一千二百二十八人，炮领催、炮甲七十二名，水手五十人，养育兵一百名，匠役四十八人，凡官兵一千七百六十二人，受杭州将军节制。