联机的关键是适用接口的开发，必须在试样组分进入离子源前去除溶剂，多采用履带式加热传送带。不足之处在于：①沸点与溶剂相近或低的组分不能测；②某种意义上失去了HPLC分离热不稳定性物质的优点；③溶剂很难挥发尽，本底效应高，不利于分辨。因此，LC/MS正处于发展阶段，应用还不够普遍。

液相色谱质谱联用仪是有机物分析市场中的高端仪器。液相色谱（LC）能够有效地将有机物待测样品中的有机物成分分离开，而质谱（MS）能够对分开的有机物逐个的分析，得到有机物分子量，结构（在某些情况下）和浓度（定量分析）的信息。强大的电喷雾电离技术造就了LC-MS质谱图十分简洁，后期数据处理简单的特点。LC-MS是有机物分析实验室，药物、食品检验室，生产过程控制、质检等部门必不可少的分析工具。