淮南军区是抗日战争时期新四军在华中地区先后组成的二级军区之一。1942年2月成立，由第二师兼军区，张云逸（后罗炳辉）兼司令员，郑位三（后谭震林）任政治委员，下辖第四旅，旅长梁从学，政治委员王集成（张劲夫代）；第五旅，旅长成钧，政治委员赵启民；第六旅，旅长兼政治委员谭希林；津浦路西联防司令部，司令员郑抱真，政治委员谭光廷；津浦路东联防司令部，司令员杨梅生，政治委员刘顺元。辖区在杨州、合肥、怀远、宝应之间。1943年春，撤销东、西联防司令部，成立东、西2个军分区，第六旅兼路西军分区，第五旅兼路东军分区。1945年10月，第二师北上山东，重组淮南军区，归华中军区领导。1946年7月，新四军撤离淮南，军区机构随后撤销。1948年2月24日，重建淮南军区。5月29日，与淮北军区合编为江淮军区。