1949年11月，番禺县人民政府设置禺东、禺南、禺北3个办事处，深井属禺南办事处。

1975年11月8日，深井大队从番禺县新造公社划归黄埔区黄埔公社。

1977年1月1日，深井大队从黄埔区黄埔公社划出，归属长洲镇。

1983年，深井大队改为深井管委会，归属长洲镇。

1987年3月，深井管委会改为深井村委会，归属长洲镇。

2002年8月1日，长洲镇改设长洲街，村委会改为社区，深井村转设为深井社区，深井转制社区属长洲街。

2023年6月25日，广州开发区规划和自然资源局、广州市规划和自然资源局黄埔区分局公布实施《中国传统村落黄埔区深井村保护发展规划》。

深井村位于广州市中部珠江前后航道交汇处，东与长洲岛相接，西与小谷围岛广州大学城相邻，北侧和海珠区新洲隔江相对，南侧与番禺区新造镇临江而望。

深井村主要山岭有马鞍岗、大飞岗，深井涌涌东到西流经全岛，南部为围田区，北部为居民区。新担涌是长洲街最长最宽的河涌，每年的黄埔区龙舟赛都在此举办。

深井村背山面水，主朝东南，形成格局为“江-山-庙/市/社/坊/街/祠/门楼-涌-塔-田” 的山水格局。深井村街巷肌理保留完好。整体上呈鱼骨状，主街由北往南依次为“安来直街-正吉大街-丛桂西街-中约下街—南田大街”，由西至东依次为“岐西坊-丛桂西街-从桂东街”，其他巷道以大部分垂直主街分布。街巷保留青石板、红米石板和麻石等原有铺砌材料，在两边的古宅石墙的映衬下，显得清幽宁静。深井古村经过了较长时期的发展，古村内新旧建筑混杂，村落空间仍然保持了清晰的传统岭南地区村落形态特征，体现出明显的地域传统风貌特色。该村古建筑群依山而建，占街巷纵横交错，还有古桥、古井以及数株古榕树、古鸡蛋花树等，以及占地3.6公顷的圣堂山公园和深井公园，一派古色古香的景象。

深井村村落建设华美，具有珠三角风情的青砖大屋、石板街巷比比皆是，其中正吉坊、岐西和荣阳里是古民宅最集中的三片。值得一提的是，深井古民居除有广州西关大屋的风格外，还吸收了客家式的碉楼和西洋式的石柱、门楼、花纹图案等建筑特色，留有中外文化交流的印痕。村落内拥有众多古建筑，包括祠堂庙宇10多间，镬耳式青砖石脚古老大屋34间，规模略小的还有百多间，而周部改建过的则随处可见，约占全村建筑的50％以上，大部分古建筑依然保存完好。

据2024年4月中国传统村落数字博物馆数据，深井村常住人口有5000多人。村内共有15个姓氏，其中人口最多的是凌姓，多是宋末元初名将凌震后裔。

深井村过去是对外贸易的集散地，村民多从事码头搬运、造船、经商等，村民生活富裕。2022年，深井村以农业、修船业、商业为主的传统产业没落，大部分村民的收入依靠外出务工、房屋出租和少量集体经济分红。

愚园，位于深井岐西坊，建于清咸丰年间，占地面积约820平方米，是民国时期广东省警察厅厅长凌鸿年的家宅。原名桂园，1919年，自深井村走出去的凌鸿年回归故里，买下了它，改名为愚园。愚园被文物专家认定为岭南地区不可多得的古建筑。

1994年6月，凌鸿年宅（愚园）作为深井古建筑群的组成部分被黄埔区公布为黄埔区文物保护单位。2009年7月、2020年8月18日，深井古建筑群被广州市黄埔区人民政府重新核定为黄埔区文物保护单位。

深井凌氏宗祠，位于深井丛桂西街3号，始建于元代，重建于明代末年，重修于清道光二十六年（1846年），是三进式建筑，占地面积900平方米。

2015年8月19日，深井凌氏宗祠被公布为第八批广州市级文物保护单位。

深井文塔位于广州市黄埔区长洲街道深井社区金洲大道旁，建于清光绪二十一年（1895年），2004年重修，坐东北朝西南，塔为三层楼阁式砖木结构，平面呈六角形，对角间最长距离6.06米，每边最大长度3米，一、二层高各约5米，三层稍高，通高约18米。红砂岩塔基，青砖墙壁，每层檐外飘约0.60米，上盖瓦，下塑四层反莲灰塑，接下为灰塑花板，塔顶六面斜坡瓦面，葫芦状陶塑饰面宝顶。文塔西南面设门，红砂岩石门夹，门额石阳刻“山明水秀”，塔内设木梯扶手上二三楼，首层原供奉土地神，二层供奉文昌、关公二帝，三层供奉文魁星。因深井村历来重视教育，文人辈出，故建塔以表彰村威，并期望后人“青出于蓝而胜于蓝”。

1994年6月，深井文塔被公布为黄埔区文物保护单位。2020年8月18日，深井文塔被广州市黄埔区人民政府重新核定为黄埔区文物保护单位。

竹岗外国人公墓内有座墓碑塔，塔高约5米，塔座约4米见方，是为了纪念美国第一任驻华公使亚历山大·希尔·义华业而建的墓碑塔。

2002年7月17日，竹岗外国人公墓被广东省人民政府公布为第四批广东省文物保护单位。

因村内水井普遍较深，后来人们干脆称它为“深井村”。

每年岁末敬老活动在凌氏宗祠（大祠堂）举行，60岁以上的长者欢聚一堂把酒同庆。据说从前“笃惠堂”承诺，凡满百岁者，席后，大太公库房白银可任你亲身一次性拿取。从1993年起，深井村每年都举办“耆英节”敬老活动，族人凌国强、凌文义、凌达镗热心捐款赞助举办。

开笔礼是中国传统中对少儿开始识字习礼的一种启蒙教育形式。在古代，学童会在“开笔礼”，即开学的第一天早早起床来到学堂，由启蒙老师讲授人生最基本、最简单的道理，并教读书、写字，然后参拜孔子像，才可以入学读书。这一仪式俗称“破蒙”。深井村每年的小学一年级入学前都会在文塔广场组织开笔礼。具体活动内容包括“启蒙教育-正衣冠-拜四方-朱砂开智-启蒙描红-击鼓明智-绕文塔”。

文化深藏的古村落深井村，建于明末清初，村内富有岭南特色的青砖大屋、石板街巷比比皆是，古老的祠堂、斑驳的牌匾、醇厚的粤曲堆砌出浓浓的古韵。

2021年12月28日，广州市黄埔区人民政府公布深井村内的黄埔区文物保护单位凌厚峰家族墓、深井古建筑群（柏轩凌公祠、深井三圣宫、念公凌公祠、充亭凌公祠、深井村洪圣宫、凌鸿年宅、前山凌公祠、景客凌公祠、肖兰凌公祠、金鼎门楼、安来市古井）深井文塔、安来市旧址的保护范围。

深井村内有非遗项目广绣。

深井村人文荟萃，村中出了不少有功名的人物，仅在清朝，已知的文武进士就有5名，村内以“进士”冠名的巷有3条。

凌福彭（1856—1931 ），清末进士，清光绪二十一年（1895年）乙未科二甲进士第三名（司科康有为二甲第二十七名），1912年后曾任北洋政界约法会议议员、参政员。

凌叔华（ 1900—1990 ），作家、画家，与林徽因、冰心齐名，著作有小说《酒后》，短篇小说集《花之寺》《女人》，散文集《爱山庐梦影》等，她的画作被世界多个博物馆收藏。

2014年9月4日，深井村被广东省住房和城乡建设厅、广东省文化厅、广东省财政厅公布为第一批广东省传统村落。

2019年6月6日，深井村被中华人民共和国住房和城乡建设部、中华人民共和国文化和旅游部、国家文物局、中华人民共和国财政部、中华人民共和国自然资源部、中华人民共和国农业农村部公布为第五批中国传统村落名录。

深井村河涌纵横，水草肥美，在这优越自然环境养出来的鹅，肉质肥美细嫩，制成的烧鹅表皮酥脆，肉嫩多汁，味道鲜美。因只有深井养出来的鹅才具有这种特色，深井烧鹅在广州各酒楼也成了招牌菜。深井烧鹅最早出于此地。

在抗日战争前与“黄埔蛋”齐名。水上居民将普通鸡苗用小竹笼挂吊在艇尾上饲养。小鸡关在长2~3尺，宽1~1.5尺，高1尺的笼里，吃的是打鱼时拣出来的鱼仔虾米，以及一些剩饭米糠，从小到大缺少运动，骨骼自然软化，故深井鸡因肉嫩、骨软、味美而引来不少慕名而至的食客。现很少人家养软骨鸡，要吃上正宗软骨鸡，弥足珍贵。

深井人采用日光干晒的方法制作霸王花。由于霸王花当造的时节是农历5到9月，晴天多，雨水也多，晒霸王花就得在雨晴的间隙收了又晒，晒了又收，晚上还要铺在青砖上风干，稍有闪失霸王花便容易变坏，坏了便得丢掉，所以品质虽好但成品率并不高。用深井的霸王花煲出来的汤，其味道清香醇厚，那带着花香的甘甜滋味。

①自驾：从大学城方向上岛，导航至深井古村；

②轮渡：鱼珠码头——长洲码头/新洲码头——深井码头，上岛后推荐骑行游玩；

③公交：乘客可乘坐公共汽车332、361、361A、383、夜65、节假日专线5路到达公共汽车深井站、公共汽车深井文塔公园站，步行前往深井村。

以深井码头、圣堂山公园和文塔公园为入口，由北往南依次经过安来直街-正吉大街-岐西大街-丛桂西街-中约下街-居安里。