清仁乡境内最大的河流为清源河，经大岩峡穿越全境至芦阳镇注入芦山河，长8.8千米，流域面积55平方千米，年平均流量6.9立方米/秒。

清仁乡主要自然灾害有洪涝、滑坡、泥石流等，洪涝主要发生在河沟地带。

清仁乡境内有个别地段产沙金。

2011年，清仁乡有耕地面积1.1万亩。

截至2011年末，清仁乡辖区总人口13414人，其中城镇常住人口565人，城镇化率4.2%，总人口中，男性6969人，占52%；女性6445人，占48%；14岁以下2089人，占15.6%；15—64岁9438人，占70.4%；65岁以上1887人，占14.1%，人口均为汉族。

截至2017年，清仁乡常住人口12984人。

截至2018年末，清仁乡有户籍人口13472人。

2011年，清仁乡财政总收入659.5万元，比上年增长34.1%。

2018年，清仁乡有工业企业40个，规模以上企业10个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市9个。

2011年，清仁乡农业以种植业为主，粮食作物以水稻、小麦、玉米、大豆为主，生产粮食7563吨，其中水稻3513吨、小麦1304吨、玉米2518吨、大豆228吨，主要经济作物有油菜、蔬菜、水果等，油菜种植面积32769亩，产量540.7吨；蔬菜种植面积5000亩，产量3718吨；水果种植面积200亩，产量386吨，主要品种有柑橘、梨、西瓜等，畜牧业以饲养生猪、牛、羊、兔、家禽为主，生猪饲养量2.7万头，年末存栏1.2万头；牛饲养量810头，年末存栏650头；羊饲养量940头，年末存栏430头；兔饲养量7.2万只，年末存栏5.1万只；家禽饲养量12.6万羽，上市家禽10.1万羽，生产肉类130吨，禽蛋75吨，累计造林8700亩，其中防护林8300亩，竹林400亩。

2011年，清仁乡有规模以上工业企业8家，工业总产值6亿元，工业增加值占国内生产总值的19%。

2011年末，清仁乡有商业网点52个，社会商品销售总额320万元。

2011年末，清仁乡有金融机构各类存款余额4209万元，比上年增长5.5%；各项贷款余额2496万元，比上年增长15.1%。

2011年末，清仁乡有幼儿园2所，在园幼儿153人，专任教师3人；小学5所，在校生731人，专任教师72人，小学适龄儿童入学率100%；初中2所，在校生1451人，专任教师93人，初中适龄人口入学率、小升初升学率、九年义务教育覆盖率均达100%。

2011年末，清仁乡有文化站1个，村级文化活动中心6个，藏书1.5万余册；老年协会表演团体2个，演职人员60多人。

2011年末，清仁乡有卫生院2个，专业卫生人员11人，其中执业医生9人，护士3人，农村安全饮用水普及率98.5%，农村卫生厕所普及率68.5%，新型农村合作医疗参合人数12859人，参合率95%。

2011年，清仁乡城镇最低生活保障户数173户，人数287人，支出60.3万元，月人均175元；城市医疗救助184人次，农村最低生活保障户数688户，人数941人，支出74.8万元，月人均66.2元；农村五保集中供养31人；农村五保分散供养26人，支出6.55万元；农村医疗救助594人次，民政部门资助参加合作医疗2091人次，共支出8.35万元；农村临时救济134人次，支出13万元，比上年增长13.3%，国家抚恤、补助各类优抚对象65人、安置义务兵、士官等3人。

2011年末，清仁乡有邮政投递点1个，乡村通邮率100%，电信服务网点1个；固定电话用户1450户，宽带接入用户350户。

能源

2011年，清仁乡有水电企业2家，装机容量3220千瓦，年发电量1600万千瓦。

2011年，清仁乡有210省道穿境，境内长2.1千米；芦灵路南北纵贯全境，境内长8.58千米；县乡公路2条，总长14.5千米，形成南通县城，西通宝兴，北通双石，东通龙门的交通网络。境内客运以过境客车为主。

清仁乡因清源乡和仁加乡合并取两乡名首字而得名。