北周，废安戎县。

隋废清水郡，清水县属天水郡。

唐初，在清水置郅州，辖清水、秦岭两县，历三年废入秦州。肃宗宝应元年（762年），县境为吐蕃所有。宣宗大中二年（848年），凤翔节度使崔珙破吐蕃收复清水，隶凤翔府。大中三年（849年），复属秦州天水郡中都督府。

北宋，清水县属陕西路秦州。南宋高宗建炎三年（1129年），金据清水。建炎四年（1130年），金升冶坊堡为县（治今黄门乡王店村），与清水县倶属凤翔路西宁州。

元代，废冶坊并入清水县，归陕西行中书省巩昌总帅府秦州。

清初，清水县属陕西省右布政使司巩昌府秦州，后改属直隶秦州。民国时期，清水先后属渭川道、渭川行政公署。

民国三十八年（1949年）8月7日，清水县人民政府成立，属陕甘宁边区政府天水分区。

中华人民共和国成立后，清水县属甘肃省天水分区行政督察专员公署。1985年7月，实行市管县体制后，归天水市管辖。

2015年11月，根据甘肃省民政厅《关于天水市秦州区齐寿乡等22个乡镇的批复》精神，经县政府研究，撤销黄门乡、郭川乡、王河乡，改设黄门镇、郭川镇、王河镇，镇政府驻地及行政区域管辖范围不变。

2017年1月，甘肃省民政厅研究同意，清水县松树乡、土门乡、草川铺乡、陇东乡、远门乡改为松树镇、土门镇、草川铺镇、陇东镇、远门镇。

截至2018年，清水县有15个镇、3个乡。县委、县政府驻永清镇。

清水县位于甘肃省东南部，天水市东北，陇山西南麓，渭河上游北部支流牛头河流域，属陇山山地向陇西黄土高原过渡地带。介于北纬34°32′—34°58′，东经105°45′—106°30′之间。东邻陕西省陇县、宝鸡市，南接麦积区，西靠秦安县，北与张家川回族自治县毗邻。全境地势由东北向西南倾斜，略呈长方形。东西长66公里，南北宽47公里，总面积2012平方公里。

清水县地处陇山山地向陇西黄土高原过渡地带，陇山余脉盘龙山、化岭山、邮山、高峰科梁构成全县地貌骨架，在牛头河及其支流流经古老基岩处形成峡谷，流经第三纪红层处，形成平川或盆地。地势自东北向西南倾斜，最高点在东北部秦亭镇的白家沟梁，海拔2201米；最低点在西南部红堡镇牛头河出境处，海拔1112米。大部分地区海拔在1500米以上，海拔在1500米以下的地区占全县总面积的14.9%。山地占总土地面积的90.8%。全境可分为4个地貌类型区。

清水县深居内陆腹地，地处东南、西南季风交互影响的边缘地带，属温带大陆性季风气候，冬季不寒冷而漫长，夏季温和而短促，几乎无夏，春秋相连，雨热同期。年平均气温年降水量564.5毫米，日照时数2166.5小时，无霜期173天。

清水县水资源分属牛头河、渭河、葫芦河、长沟河4个水系。水资源蕴藏量为2.5亿立方米，其中自产地表水资源量1.72亿立方米，地下水净资源量0.027亿立方米，人境水资源量0.75亿立方米，分别占全县总水资源量的69.90%、1.09%、29.01%。

清水县境内勘察探明的各类矿藏近20多种，金属矿主要有金、镁、铜、铅、锌、钥、镇、铁、锰等；非金属矿主要有大理石、花岗岩、辉绿岩、石灰石、白云石、石英石、钾长石、磷灰石等，已开发利用的有金、铅、锌、铁、地热水、铁、白云岩、粘土、花岗岩、片石、辉绿岩等矿种。

清水县森林中野生植物达2000余种，生长着杨、桦、椴、松、栎、楸等250种木本植物。其中有杜仲、祖师麻等珍贵植物，沙棘、山梨、草莓、山葡萄、五味子等野生果类资源也较丰富。野生动物中列入国家二级保护动物的有金钱豹、斑铃、鬣羚、云豹、林麝、毛冠鹿、水獭、猞猁、鸳鸯、红腹锦鸡等10余种。中药材有70科165种，大部分为野生药材，主要有半夏、沙参、大黄、独活、升麻、甘草、猪苓、柴胡、五味子、元胡等植物药材以及鹿茸麝香、豹骨等名贵动物药材，年产量2000吨。有野生牧草25科183种，以禾本科、莎草科、豆科、菊科为主。

截至2018年底，清水县总户数达79131户，其中农业户68132户，非农户10999户。总人口达332364人，其中农业人口304017人，非农人口28349人。年末常住人口27.72万人，其中乡村人口20.36万人，城镇人口7.36万人。年平均常住人口27.65万人，其中乡村人口20.52万人，城镇人口7.13万人。2018年，全县人口出生率为10.2‰，人口死亡率为4.16‰，人口自增率为6.05‰。清水县境内少数民族有回族、藏族、白族、朝鲜族、土族等。

2020年末，总人口33.2万人，其中，农业人口30.4万人。

2018年，清水县实现地区生产总值44.51亿元，同比增长2.4%，第一产业完成增加值9.76亿元，同比增长4.3%，第二产业完成增加值6.07亿元，同比增长5.8%，第三产业完成增加值28.68亿元，同比增长0.8%，三产业比例为21.93:13.63:64.44。规模以上工业增加值达到4321.35万元，同比增长3.6%；固定资产投资达到17.8亿元，同比下降49.89%；社会消费品零售总额达到9.78亿元，同比增长8.2%；大口径财政收入达到4.41亿元，同比增长6.67%；城镇居民人均可支配收入25190.8元，同比增长7.9%；农村居民人均可支配收入7004.01元，同比增长8.79%。

2018年，清水县共完成固定资产投资总额178014万元，较上年下降49.89%，其中：项目投资完成172581万元，较上年下降46.24%；房地产投资完成5433万元，较上年下降84.13%。完成大口径财政收入44100万元，同比增长6.67%。财政支出282283万元，同比增长9.99%。

2018年，清水县职工总数为11434人，工资总额74270.5万元，人均工资65564元，其中国有单位职工人数11140人，工资总额72565.5万元，人均工资65759元；集体单位职工160人，工资总额1174.8万元，人均工资73425元，其它经济从业人员134人，工资总额530.2万元，人均工资39865元。农村居民人均可支配收入7004元，较上年增长8.79%，农民人均产粮548公斤，较上年增加24公斤。城镇居民人均可支配收入达到25190.8元，同比增长7.9%。

2020年，清水县地区生产总值368595万元，完成财政收入49919万元，同比增长6.42%，财政支出295359万元，同比增长16.03%。

2018年，清水县农业总产值达到162867万元，较上年下降15.85%；农业增加值98658万元，按可比价较上年下降15.44%。全年农作物播种面积91.04万亩，其中：粮食作物播种面积65.25万亩。全年粮食总产量16.66万吨，同比下降0.21%。经济作物播种面积16.31万亩，其中：油料作物播种面积12.47万亩，油料总产20830.36吨。果园面积达到16.49万亩，水果总产量107458.6吨，核桃产量12016.95吨，花椒产量713.2吨。当年造林面积1.14万亩。大牲畜存栏48596头（匹、只），其中：牛存栏40640头，年末猪存栏74514头，当年猪出栏114984头，年末羊存栏33757只，年末鸡存栏53.09万只，当年鸡出栏32.85万只。农业机械总动力142053.8千瓦。

2018年，清水县完成规模以上工业总产值29635.41万元，较上年下降2.8%，其中：轻工业完成工业总产值15298.71万元，较上年下降5.5%；重工业完成工业总产值14336.7万元，较上年增长0.3%。完成工业销售产值28603.08万元，较上年下降3%，其中：轻工业完成工业销售产值14347.58万元，较上年下降6.3%；重工业完成工业销售产值14255.5万元，较上年增长0.6%。

2018年，清水县实现规模以上工业增加值4321.35万元，同比增长3.6%，其中：轻工业完成工业增加值2390.91万元，较上年增长10.9%；重工业完成工业增加值1930.44万元，较上年下降4.3%。全年实现规模以下工业增加值1.06亿元，同比增长0.4%。

2018年，清水县实现社会消费品零售总额97804.8万元，较上年增长8.2%，其中，餐饮业零售额19139万元，较上年增长9%，商品零售额78665.8万元，较上年增长8%。商品销售额203418万元，较上年增长12.9%，其中：批发业商品销售额52864.9万元，较上年增长9.9%；零售业商品销售额150553.2万元，较上年增长14%。零售额77981万元，较上年增长8%，其中：批发业零售额8461.5万元，较上年增长14.8%；零售业零售额69519.5万元，较上年增长7.2%。住宿业营业额13915万元，较上年增长13.44%，餐饮业营业额22719万元，较上年增长15.73%。

2018年，清水县金融机构完成各项存款659021万元，较上年增长9.56%。各项贷款368654万元，较上年下降2.83%。存贷比55.94%。年内实现邮政业务总量2146.78万元。

2018年，清水县开展科技骨干培训2000人（次）、普及型培训2.1万人（次）。建成各级科技示范点22处，引进新品种18个，推广新技术21项，完成专利申请23件。

截至2018年底，清水县有各级各类学校358所，其中：独立初中21所，附中4所，完全小学75所，教学点159个，幼儿园96所。中、小学在校学生41454人，其中：小学24159人，初中12088人，高中5207人。学前教育共有学前班95个，入学幼儿826人，入园幼儿9643人。全县有教职员工3770人，其中：专任教师3557人。入学率达到100%。辍学率0，毕业率100%，完成率100%。2018年高考二本以上上线人数762人，其中：理科上线619人，文科上线143人。本科上线率40.42%。

2018年，清水县广播乡通播率达到100%，实现广播时间6387.5小时，电视机113452台。通电视村数260个。电影放映场次3144次，观众人数159020人（次）。

截至2018年底，清水县有卫生机构349个，其中：综合医院1家，中医医院1家，中心卫生院12个，乡卫生院9个，村卫生室260个，社区卫生服务中心1个，诊所58个，卫生室、医务室3个，专业公共卫生机构4个。各类医务人员1147人，其中卫生技术人员592人，病床总数872张。

2019年8月，入选为紧密型县域医共体建设试点县。

2018年，清水县举办体育运动会4次，参加运动会运动员2680人（次）。

清水县是甘肃的东大门，距陇海铁路天水站40公里。全县18乡镇全部通沥青路或水泥路。省列重大交通项目天平铁路、庄天二级公路贯穿全境。

2018年，清水县公路总里程达到1649.248公里，其中：二级公路57.702公里，三级公路105.275公里，四级公路1259.756公里，等外公路226.515公里。桥梁67座2225.43米。完成客运量271.37万人，旅客周转量14876.83万人公里，货运量60.59万吨，货物周转量12432.02万吨公里。

清水县西南经省道305线到北道埠天水火车站44公里，至天水市人民政府驻地秦州区63公里，西经云山镇至秦安县城77公里，北经省道305线至张家川回族自治县城47公里，西距省会兰州市395公里，东经陕西省陇县至西安市380公里。

截至2015年7月，清水县非物质文化遗产有36项已列入国家、省、市、县“非遗”保护名目。其中“清水道教音乐”已列为国家级非物质文化遗产保护项目；“清水剪纸”和“清水道教音乐”已列为省级非物质文化遗产保护项目；“清水民间故事”、“清水麻鞋”、“清水轩辕鼓舞”、“清水酿酒技艺”、“清水脊兽制作技艺”、“清水庞公玉雕技艺”、“清水小曲”、“清水砖雕”、“清水造纸技艺”、“清水城隍庙会”、“清水木人绊跤”已列为天水市非物质文化遗产保护项目；“清水扁食”、“清水婚俗”、“清水木雕”、“清水扎灯”、“清水高抬”、“清水彩绘”、“清水皮影、“清水戏剧脸谱绘制工艺”等已列为清水县非物质文化遗产保护项目。

清水社火

社火是民间各种歌舞形式的总称，广泛流行于清水城乡。清水社火装扮内容丰富，有30多个类型。以打击乐或民间小乐队伴奏的主要有舞龙灯、耍老虎、舞狮子、高台、跑毛驴、耍武术、马社火、打腰鼓等；边歌边舞的有跑旱船、踩高跷等，风格多样，活泼风趣。题材以历史故事、神话传说、戏剧故事为主。

清水山歌

山歌，也称“山野之曲”，是清水民歌的组成部分。清水山歌通常为独唱或对唱形式。歌词句式长短多变，一般为七字句。表现形式自由，以即兴创作为多，一曲多词较为普遍。基本曲调为慢、快两种。慢调为上下句结构，深情舒缓，婉转优美；快调为四字句，多为一字一音，不拖腔，行腔多起伏、高亢、粗旷。

清水小曲

清道光年间（1821年—1850年），清水小曲主要有“坐唱”、“清唱”两种形式，由一人敲“四片瓦”，随地演唱，人员少，化妆简单。民国时，发展为“地摊子”，始有简易乐队，由一把板胡或二弦伴奏，另一人打一竹板演唱。中华人民共和国成立后，引子曲牌套体形成，增加二胡、笛子、月琴、大锣、碰铃”等乐器，原来单一抒情的短歌，逐渐演变为可叙述故事、描绘人物的说唱体裁。旋律流畅，优美抒情，风格上与陕西眉户相近，情节诙谐风趣，情感真挚。曲调或慷慨激昂，如《闹生产》；或如泣如诉，如《五更鸟》。内容主要表现劳动者的勤劳勇敢、青年男女对自由、幸福的渴望。

清水道教音乐

道教音乐又称道教乐曲。始创于明万历年间（1572年—1620年），为声乐、器乐结合的演奏形式。在流传中始终固守传统的艺术风格。清水道情乐曲分“华山”、“龙门”两派，乐曲结构大都以简单的素材为基础，通过加花减花，延伸紧缩和节奏的快慢变化发展旋律，并由若干衔接的单体曲调发展为结构紧密的联曲体，用于“道场”祭祀和大型庙会等场面。在乐曲转换上，用打击乐进行“拆头”或“搭尾”，以转换过渡，造成结构上连绵不绝的效果。两派音乐在曲调上各有特点，“龙门派”声乐曲调多显低回缠绵、婉转柔和、结构严谨、旋律性强的特点；“华山派”声乐曲调则以柔中带刚、节奏舒展等特点见长。2007年，清水华山派道教音乐被列入国家级非物质文化遗产保护名录。

清水剪纸

清水剪纸的雏型，最早可追溯到先秦时期金箔饰品上的“V”字型文饰。简洁明快，带有强烈的乡土气息。剪纸题材广泛，内容丰富，且多与劳动人民的生活习俗密切相关。内容主要有人物故事、历史传说、花鸟鱼虫、飞禽走兽、瓜果树木、吉祥图案、吉字祝词等，样式常见的有长方形、圆形、三备形和变体形4种，花纹有回形纹、水波纹、丁拐纹、菊花纹、斜线纹、菱形纹等。

截至2014年12月，清水县境内发现仰韶文化等古文化遗址190余处，出土珍贵文物6000多件。现存鲁公姬造像碑国家级文物保护单位1处，永清堡遗址等省级文物保护单位3处，县级文物保护单位46处。

赵充国陵园

赵充国陵园，位于清水县城北1公里处的牛头河畔。始于汉，后历代辟祭田，修祭殿，勒石刻碑，铭期史迹。1962年公布为甘肃省重点文物保护单位。现占地面积7000多平方米。陵园建筑典雅肃穆，气势恢宏，环境幽雅，景色宜人。墓区现存历代石刻碑廊，宋墓群等省、县级文物保护点十多处。其中鲁恭姬造像碑于2006年被列为国家级文物保护单位，归入第一批全国重点文物保护单位麦积山石窟。

宋金墓群博物馆

清水境内已发现宋金时期砖雕彩绘墓葬30多处。20世纪80年代以来，县文化部门陆续将数座砖室墓搬迁至赵充国陵园内，建成宋墓博物馆，对游人开放。2003年，博物馆被甘肃省公布为省级重点文物保护单位。

花石崖又名万紫山，位于清水县陇东乡。在县城东南28公理的陇东土寨村之涧沟河下游、渭河北岸盘龙山中段，西北向支峰南坡，海拔最高处1823米，山对面下到五里为310国道。所有建筑物都依山势逐台修建，大体可分为“磨针殿”、“大殿院”、“玉皇顶”、“雷音崖”四大部分，从谷底沿山而上，有一巨石平地而起，高约50米，顶阔而平，大约有10平方米，称“磨针殿”，殿内有隋代塑像二尊，均为明清作品。

位于山门镇东南10公里处的三皇谷森林公园2003年被列为省级森林公园，隶属于小陇山林业实验局山门林场，地处秦岭山脉与关山山脉的结合部，是牛头河的发源地。该公园距清水县城40公里，海拔1600——2100米，年平均气温8℃，相对湿度70%，森林覆盖率达76.1%。

庞公仙境也称庞公庵、小华山，位于清水县城西7公里的红堡镇吴湾村，占地面积千余亩。宋代已为道观名山，曾有宋代湖北襄阳人庞蕴云游至此，在此地修道成仙而得名。明清时期成为陇上佛道两教圣地之一。曾有三进院落殿亭楼阁30多间，石刻造像10画（件）。有庙宇建筑5座，塑像10余尊，彩绘壁画200平方米。

石洞山位于清水县城以东30公里处的山门镇西南部，海拔1700多米。占地1956亩，森林面积1500亩，因古洞悬石得名“石洞山”。进入景区主要以岩洞观光为主，集森林、悬壁等自然景观与历史人文背景于一身，辅以林海和山石景观。在洞穴内可见断层，裂隙岩层结构，崩塌、石堆等各种地质地貌现象。

2019年12月25日，入选“国家级农村职业教育和成人教育示范县（第五批）”。

2020年3月，获得全国村庄清洁行动先进县称号，被中央农办、农业农村部予以通报表扬；入选2020中国慈善公益百佳县市；入选2020中国青年乐业百佳县市。

2020年7月29日，被全国爱国卫生运动委员会命名为“2017-2019周期国家卫生县城”。入选“2020中国职业教育百佳县市”。

2020年9月29日，被交通运输部、财政部确定为“深化农村公路管理养护体制改革试点地区”。

2021年1月18日，被国家卫生健康委命名为“2018-2020年全国计划生育优质服务先进单位”。

2021年2月1日，被表彰为“创建全国无障碍环境达标市县村镇”。

2021年9月8日，入选国家能源局综合司整县（市、区）屋顶分布式光伏开发试点名单。

2022年3月29日，入选国务院教育督导委员会办公室拟公布通过义务教育均衡发展国家督导评估 认定县（市、区）名单。

2022年4月19日，入选甘肃省文明办公示的2021年甘肃省新时代文明实践中心建设试点工作优秀县（市、区）名单。

2022年4月，甘肃省食品药品安全委员会命名为甘肃省食品安全示范城市。

2022年11月18日，被生态环境部命名为第六批生态文明建设示范区。