2020年4月20日，合肥轨道交通5号线各站站名正式确定。

合肥轨道交通5号线各站站名由南向北分别为：贵阳路、滨湖竹园、云川公园、清水冲、云谷路、华山路、沈湾、渡江纪念馆、方兴湖、省政务中心东、义城、扬子江路、黄河路、花园大道、大连路、义兴、包河苑、盛大、合肥南站、望湖城西、凌大塘、休宁路、市第三医院、中国科大东区、稻香楼、三孝口、杏花公园、白水坝、海棠、北五里井、菱湖公园、六中菱湖校区、汲桥路。

合肥轨道交通5号线经过滨湖新区、包河区、蜀山区和庐阳区，线路基本沿云南路、云谷路、上海路、河北路、繁华大道、南站综合交通枢纽、庐州大道、南二环、宿松路、金寨路、蒙城路、丽水路、太和路走行；全长40.2千米，均为地下线。