湖北省伊斯兰教协会于1984年5月成立，初期会址设在武昌起义街67号清真寺内。2011年10月，湖北省伊协迁入新办公楼，新址位于洪山区雄楚大道。

省伊斯兰教协会自成立以来，先后召开了五次湖北省伊斯兰教代表大会。全省伊斯兰教第一次代表会议于1984年5月3日至7日在武昌召开，会议审议通过了《湖北省伊斯兰教协会章程》和《湖北省伊斯兰界人士爱国公约》，选举产生了马公瑾为主任的省伊协第一届委员会。第二次代表会议于1989年12月26日在荆州江陵举行，选举产生了以马维清为会长的省伊协第二届委员会。第三次代表会议于1997年5月26-28日在武昌召开，马维清连任省伊协第三届委员会会长。第四次代表会议于2005年11月30日至12月1日在省社会主义学院召开，选举产生了以安永汉为会长的省伊协第四届委员会。第五次代表会议于2011年12月5至6日在武昌东湖宾馆召开，会议审议通过了《湖北省伊斯兰教协会章程》（修正案），选举产生了湖北省伊斯兰教协会第五届委员会。其中：委员75人，常委39人，正副会长10人，正副秘书长7人。