当玖辛奈初到忍者学校与同学们初次见面的时候，她遇到了水门。不过当时还是小孩子的她并不对水门抱有任何好感，在她看来，他是一个既无法让人信赖，又很无聊的人。当同学们问起玖辛奈将来的梦想时，她不想被人看扁，并想给同学们留下深刻印象，便吼出“我要成为第一位女火影!”这样的“豪迈”宣言。但同学们并不吃这一套，他们认为一个初来乍到的小丫头张口就嚷嚷著要当火影，太不自量力了。于是男生们纷纷开始捉弄玖辛奈，看到她有著火红的头发和圆圆的脸蛋便给她起了个绰号叫“西红柿”。本来玖辛奈自己也认了，但男生们依然不依不饶，气得她有一次尾随这些男生然后把他们一个个揍扁。于是玖辛奈又获得了一个新的称号：血红辣椒。这也是她一开始非常厌恶自己的红头发的原因。

轮到水门发言时，水门希望村子所有人能够认同他，并成为一个伟大的火影。但玖辛奈听到时却认为“像他这样既傻乎乎又古怪的人是不可能成为火影的。”所以直到绑架事件发生前，她一直瞧不起水门。

因玖辛奈的查克拉特别，被雷之国云隐村盯上，他们悄无声息的潜入玖辛奈家中，玖辛奈放学回到家后便被云隐的三名上忍绑架，玖辛奈一路上趁押送的云忍不注意，偷偷拔下自己的头发扔在路上做标记。木叶方面立即派出了追兵寻找，但一无所获。在当临近国境线，玖辛奈开始绝望的时候，水门一人发现了标记并顺着标记追来。在打败了那些云忍，成功上演“英雄救美 ”之后，水门抱着玖辛奈，微笑着看着她，夸奖她的头发很漂亮。原来水门一开始就很喜欢玖辛奈的红头发，所以对其印象非常深刻，也正因为如此他才能顺利地找到玖辛奈。

这时玖辛奈发现眼前这个曾经被自己所看轻的男孩——波风水门，是一个真正能够实现梦想的人，是一个真正值得她信赖、依靠和托付终生的人，最重要的是——他改变了自己。玖辛奈原本最讨厌的红头发最后成为了她命运中的因缘红线，带领她找到了自己的忠实伴侣，并将二人牢牢地绑在了一起。从此玖辛奈开始喜欢上自己的红头发，更重要的是她爱上了水门。

成年后，由于第一任九尾人柱力旋涡水户即将寿终正寝，木叶方面出于战略需要，为了维持尾兽制衡，木叶选定玖辛奈作为新一任九尾人柱力，从而秘密地把她带到了木叶。当玖辛奈得知自己即将作为九尾的容器时，按她所说的感受就是，那种随之而来的孤独压抑的感觉快要让她窒息了。明明不愿意，却又不得不接受这个残酷的现实。

而在玖辛奈最无助的时候，水户婆婆微笑地开导她，最终她们被带来此地，成为九尾的容器……但在尾兽被安置之前，她们需要先用爱填满它。也正是这句话，让玖辛奈能够放下思想包袱，以乐观的态度去面对人生，最后顺利成为了新的人柱力。

因为此次人柱力的更替只有木叶高层知晓（连三忍都不知道），所以玖辛奈在木叶村几乎没有像鸣人一样遭到村民的歧视与排斥。

睡觉的玖辛奈梦见九喇嘛对自己的蛊惑惊醒过来，水门任务归来后。玖辛奈希望继续封印术的修行，水门说道有新忍术练习便离开。

玖辛奈前往第3演习场看见水门新忍术的修炼，2人闲谈时，玖辛奈突然尾兽化并打伤水门，水门不顾伤势使用八卦封印控制住九喇嘛，恢复理智的玖辛奈与水门合作重创九喇嘛。

伤愈的水门与玖辛奈聊到新忍术，因为还没决定名字。水门取名光轮冰棍启发旋毛自来也双式丸，被玖辛奈吐槽又土有长。玖辛奈说是为自己开发的，那就叫螺旋丸，水门觉得螺旋丸的名字很不错。

琳生日将近，带土跟卡卡西、水门打招呼，希望都对琳生日礼物的事保密好给琳一个惊喜。3人在演习场商量怎么给琳惊喜时，玖辛奈怒气冲冲的找上3人。说道没给琳准备生日礼物太过分，3人无可奈何阻止暴走的玖辛奈。打完后，卡卡西让带土不要演了。带土说出计划后玖辛奈仍旧不依不挠，将水门与卡卡西、带土被玖辛奈狠狠的揍了一顿。

以上剧情来自究极风暴4

玖辛奈带着吃的前往演习场探望水门班，见到演习完的众人。让他们填饱肚子，结果带土拒绝，玖辛奈与带土拌嘴。回到家，玖辛奈聊到三战与学生们的事。

晚上，玖辛奈送行水门班，与带土约好平安归来，望着水门班前往神无毗桥完成任务。

以上剧情来自究极风暴革命

不久后，玖辛奈已怀有身孕，夫妻二人都对自来也的处女作《坚强毅力忍传》中有著永不放弃精神的主人公“鸣人”的形象铭记在心。因此在水门提出要藉用小说主人公的名字为自己即将出世的儿子命名时，玖辛奈坚定地支持水门的想法认为，“鸣人”是个很不错的名字。她与水门都对自己的儿子寄予了厚望。

在九尾人柱力漩涡玖辛奈即将分娩之时，木叶高层相当重视。因为女性人柱力在怀孕期间，封印抑制尾兽的能量都去用来孕育胎儿，会导致封印减弱，之前水户分娩的时候封印就差点解开。三代提议将产房设置在村外，并由严密的结界和众多直属火影管辖的暗部高手保护。三代之妻猿飞琵琶湖与另一位暗部女忍田路担任接生婆，同时水门也会在旁边陪同保护玖辛奈并保住封印不被解开。一切准备就绪后，玖辛奈与琵琶湖开始前往村外，途中遇到好友宇智波美琴，与其聊天，得知美琴怀中所抱的婴儿正是已出生两个多月的宇智波佐助。玖辛奈希望将来鸣人能和佐助成为好朋友，但两位妈妈谁也没想到鸣人与佐助会掀起翻天覆地般的巨变以及他们之间会产生深深的羁绊。

在产房中，九尾数次想要冲破封印，但都没成功。最后玖辛奈有惊无险地生下了一个健康的男婴——鸣人，水门为此高兴地流下了眼泪。而在产房外，众多暗部忍者却被前来寻衅的一个自称为“宇智波斑”的“面具男”（实为宇智波带土）悄无声息地秒杀，随后“面具男”用时空忍术穿透岩壁进入产房，瞬间杀害了两位接生婆后夺走了鸣人，并用卑鄙的手段强迫水门带着救下来的鸣人用飞雷神之术离开了玖辛奈的身边，而玖辛奈的封印尚未修复完成。

随后“面具男”再度用时空间忍术将玖辛奈带到室外某地方，告诉玖辛奈此事他早就蓄谋已久，要用九尾来摧毁木叶。随后“面具男”便用写轮眼控制九尾冲破了封印。尾兽被抽出，但玖辛奈并未立即死亡，因为她拥有漩涡一族的强悍体质，这令“面具男”都感到惊讶。接著“面具男”操纵九尾攻击玖辛奈，玖辛奈幸运地被水门救下。之后水门将极度虚弱的玖辛奈带回家安顿好，玖辛奈抱著睡著的鸣人哭泣，水门换好衣服便急赴木叶村。

而“面具男”先到一步，将九尾用通灵术通灵过来，引发灾难。三代组织人马奋起抵抗，赶赴到现场的水门用时空间结界术转移走了九尾的尾兽玉。紧接著水门与“面具男”交战，并凭借出色的谋略分析出他的弱点进而击退了他。之后再度回到木叶，看到木叶的惨状，联想到“面具男”的野心，心中默念：“对不起了，玖辛奈。”随后将正在准备发射第二发尾兽玉的九尾连同自己一起瞬移到自己家附近，同时带出玖辛奈和鸣人，准备将九尾再度封印。

玖辛奈用查克拉锁链勉强将九尾捆住并制造出结界，但却因身体已经达到了极限而吐血。鸣人被吵醒后哇哇大哭，她用无比温柔的眼神望着鸣人说，对不起，不是故意把他吵醒的。玖辛奈的觉悟，是想用仅存的查克拉跟九尾同归于尽，以保护水门和鸣人。当她强忍痛楚，微笑著说谢谢水门为她所付出的一切时，水门心中无比愧疚，怪责自己受到玖辛奈那麼多的帮助，但他到最后却没能够很好地保护母子俩。而玖辛奈并不埋怨，更没有悲伤，而是表示很开心很幸福，不仅理解和鼓励水门，还对水门说出了让他感动得再度流泪的爱的告白，并表示她唯一的遗憾，就是无法看到长大后的鸣人了……

最终水门做出了自己的选择：为了夫妇二人可以在鸣人长大之后与其见上一面，为了能让爱人不留遗憾，为了能让鸣人拥有彻底打败面具男的力量，同时也为了木叶村、火之国，乃至忍界的和平与安定，毅然决定牺牲自己的生命，由自己来封印九尾，并将九尾的一半查克拉以及自己和玖辛奈最后的查克拉一并封印在鸣人身上，让夫妻俩都能够在鸣人体内陪伴著鸣人成长，并设定封印程序使他们能在最关键最危急的两个关头（地爆天星那次和控制九尾那次，都是鸣人差点就要被九尾吞噬的时候）给予鸣人最大的帮助。

玖辛奈强烈反对水门的做法，认为其不应该就这样牺牲自己并且还让鸣人从小就背负如此沉重的负担，而是应当活下去抚养和教导鸣人成长。水门则坚持己见，阐述自己的想法，并说忍村灭亡的孩子不会幸福，玖辛奈自己就能够了解，最后终于说服了玖辛奈。之后水门先用尸鬼封尽封印了九尾的阴性查克拉，然后开始用八卦封印准备封印九尾的阳性查克拉。九尾发觉了水门的企图，趁玖辛奈虚弱之际（捆缚的锁链松动）要杀死鸣人，但被水门与玖辛奈夫妇拼死挡下。玖辛奈在临终之际，和天下所有母亲一样，含泪对鸣人诉说爱意。而这第一次对孩子的爱的叮咛，对初为父母的他们而言却也成为了唯一一次……

最后，九尾被封印，水门和玖辛奈双双牺牲。

在鸣人与九尾展开激战，眼见得手却反被九尾憎恨意志控制，就在快要被憎恨吞噬的危急时刻，玖辛奈出现了（和水门的出现一样，都是由封印设定程序启动。）

已经被憎恨侵蚀了一半的鸣人心志大乱，误把玖辛奈当做九尾本体，玖辛奈于是捧腹大笑，鸣人想冲过去打她，却被玖辛奈一拳揍醒。

但当之后鸣人终于认出眼前的正是自己的母亲时，一把将其紧紧抱住，哭泣。见到母亲的样子是鸣人十几年来的愿望，而当他真的见到了母亲时，虽然悲伤委屈的情绪一股脑涌上心头，但又由衷地感到高兴，先前内心被憎恨侵蚀所产生的黑暗也顿时烟消云散。在之后的母子谈心中，鸣人十分兴奋，特别是当他发现妈妈是个大美女时，快乐得像个小孩子。玖辛奈也和鸣人一样，有著奇怪的口头禅。她不但排解了儿子心中的迷茫，还回忆了自己与水门相爱时的情景，此时的她，只有幸福而又羞涩的笑容。当鸣人就像曾经的水门一样夸奖玖辛奈的头发漂亮时，她无比地开心，对鸣人，也对水门说出了她要赠给每一位称赞她的头发漂亮的人的一句话：“我爱你。”父亲的信赖、母爱顿时给了鸣人无穷的力量，九尾的憎恨再也不能侵蚀他了。最后鸣人在母亲的帮助下封印九尾，夺走了它的查克拉并用六道仙人的封印术将其再度封印。之后玖辛奈说她的任务已经完成，可以放心地去找水门了，鸣人的脸上掩饰不住失落之情。在临走之前，她还是想让自己的儿子知道16年前灾难的真相，于是夫妻二人间的伟大故事便由此展开。

最后回忆结束时，玖辛奈抹着眼泪向鸣人道歉，鸣人微笑著说完全不用，虽然他作为人柱力之前活得很辛苦，也一直没有感受过父母之爱，但他从未责怪过父母，而且他也已经体会到了父母的伟大。正像水户所说的一样，父母的爱早在九尾被封印之前就将鸣人填满了。鸣人用他那经典的笑容告诉自己的母亲，能成为他们的儿子，真是太好了!让玖辛奈很感动。查克拉就要耗尽了，玖辛奈的身体开始消散，她再度拥抱鸣人，并表示感谢鸣人能够理解他们，之后在鸣人面前完全消失。