1998年11月，揭露祭坛，在东城门内发现建城之前汤家岗文化时期的聚落遗存。

1999年11月，发现了大溪文化一期早段（建城前）的稻田遗迹。

2000年11月，对城的西北部位发现大溪文化时期所筑一、二期城墙的环壕。

2001年，发现大型厅堂或宗庙式建筑，近百个祭祀坑。

城头山遗址，位于湖南省澧县车溪乡城头山村，地处澧阳平原西北部，东南距澧州古城（澧县县城）10公里，东经112°，北纬29°附近。总占地面积约15.2万平方米，已发掘面积近9000平方米。

城头山古文化遗址在高出四周平原2—4米的矮岗上，发掘表明，距今7000年前就有人类在这个岗地上居住和从事生产等活动。大约5000年前，人们即筑恒为城，作为防御，现存墙体宽25—37米，城高2—4米。城址保存较好，平面呈圆形，由护城河、夯土城墙和东、西、南、北四门组成，占地76000多平方米（不包括护城河）。

城头山西南城墙，发现有四次大规模筑城的过程，形成相应的四期城墙，从下到上累次加高，每期城墙都有内外坡的堆积层。其中第一期城墙年代最久，距今6000年左右，直接筑造在原生土面上，未见明显的夯筑痕迹。

南门为古城早期的陆地通道，发掘有大溪文化早期的壕沟，壕沟外坡发现有用竖立木桩，芦席，横木条和子篾扎紧成篱笆状的相当坚实的护坡设施，保存十分完整。壕沟中还发现了一件制作非常精致且保存完整的木浆、艄及壕沟上架设的木桥（已垮塌）。

保存较好，规格较高，规模较大的有三座屈家岭文化时期的房址，集中分布在城址中心附近。它们均筑有四面坡下的黄土台基，而后再在台基面上挖基槽，修整居住面，然后起建，平面形状为方形或长方形。

一座是小型排房，中间为走廊，两边对称分布小房间，单个居室面积仅3～5平方米，表明已有分室而居的现象；一座是套房，前为餐厅，后为有四个连体灶的厨房；另一座是大型殿堂式建筑，室内面积达到63平方米，专家推定或为祖庙。房屋因使用功能不同而出现结构上的分化，是这一时期房屋建筑的一大特点。

在城南壕沟淤泥中，出土了稻、瓜等170多种人工种植和野生植物籽及猪、羊、狗、鹿等20多种家养和野生动物骨骸，其时间超过了1974年在浙江发现的河姆渡遗址。距离城头山遗址1公里处，还发现距今约8000年的人工栽培稻；距离城头山遗址10多公里处，则发现了距今约8000年的大量稻田实物标本，其中40%有人工栽培痕迹，有水坑和水沟等原始灌溉系统，是现存灌溉设施完备的世界最早的水稻田。

在城头山遗址，已发掘10座陶窑, 其中7座位于城址中部，有红烧土块、灰坑和灰沟，专家推测为砖的前身。另外，邻近还有多座简易工棚一类的建筑，仅见柱洞，不见基槽，它们与邻近陶窑一道构成了一个完整的制陶区，规模宏大，设施齐全，保存完整。这些陶窑、灰坑、灰沟和简易工棚一类的建筑都属于同一时期，即大溪文化第三期。

此外，还发现有斟酒器陶鬶和贮酒器陶瓮，陶鬶、陶觚和陶温锅的发现，说明城头山及周边地区，5000年前饮酒已相当普遍和讲究，酒文化的发展已达到相当水平。陶温锅的发现，证明在城头山已出现了酒肆（酒店或酿酒手工作坊），从而将卖酒行业的出现大大提前。

在城头山遗址东门豁口角城内，现存一个用黄色纯净土筑造的建筑基址，黄土台略呈椭圆形，面积约250平方米，在平地堆筑夯打而成，中间高，向边沿倾斜，在较高部位有五个圆坑，坑中置放大块卵石。在土台至高点有一个径近1米，深0.2米，底部平整、圆边极规则的坑，在坑中，平放着一块椭园形的大卵石。东缘发现数量甚多的大溪文化早期墓葬，墓坑四角之外各有一座没有随葬品的屈肢葬墓。其中一座墓的骨架葬于一大圆坑中，坑内随葬有牛的下颚骨和鹿牙，但没有陶、石器，专家考证所葬为巫师。

城头山发现和揭露的是一座时代最早的完整祭坛和众多的祭祀坑，是大溪文化早期从事祭祀和宗教活动的大型祭坛。在同时期的各地发现中，它是最大、最完整也是揭露得最清楚的一处。

城头山城址的发现，表明长江流域也是中华文明的摇篮，对研究人类文明的起源、早期城池的起源以及阶级、国家的产生具有意义，并改写了中国的史前史。

在城头山古城未确证之前，中国已知最早的一座城为仰韶文化晚期筑造的河南郑州西山古城，距今约5300年。而城头山遗址始建于6000年前，从规模、从功能、从工程规划施工来看，已经属于“城”的范畴，曾为统领一方的政治中心，考古学家苏秉琦认定为“古国”。

在城头山遗址发掘出有三丘古稻田，稻田西边的原生土上，有人工开凿的水塘、水沟等初步配套的灌溉设施，距今6000-6600年，这是现存灌溉设施完备的世界最早的水稻田。城头山古水稻田的发现，代表了长江流域新石器时代古文明的发展高度，对研究长江流域文明因素的形成、世界稻作农业的兴起和发展等具有重要的学术价值，并驳斥了“中国水稻是由南亚传来的”这一传统观点。

1992年，城头山古文化遗址被评为全国十大考古发现。

1995年，国家主席江泽民考察澧县，题写了“城头山古文化遗址”。

1996年，城头山古文化遗址被国务院公布为全国重点文物保护单位。

1997年，再次获评全国十大考古新发现，成为唯一一个两次获此殊荣的古遗址。

2002年，澧县政府批准成立城头山古文化遗址管理处，开始在原址修建“城头山古文化遗址博物馆”。

2003年，澧县政府正式确立了博物馆管理处机构；7月，组建了基本工作队伍。

2004年，澧县政府组织修建了西南城墙剖面保护展示馆。

2005年，城头山古文化遗址被确定为“十一五”期间国家重点大遗址保护专项单位，获得专款资助。

2006年，城头山古文化遗址被团中央命名第四批全国青少年教育基地。

2010年，城头山被授予“省级地质公园”称号。

2010年，湖南省政府批准成立“湖南省澧县城头山遗址保护利用工作领导小组”，统一协调指导城头山遗址的保护利用工作。同年5月，城头山做为“中国最早的城市”被制作成大型模型，在上海世博会中国馆展出。

2011年，城头山古文化遗址被正式列入国家“十二五”大遗址保护开发项目，成为湖南省古文化遗址重点保护开发工程。湖南省政府开始兴建集“遗址保护、文化展示、旅游休闲”于一体的国家考古遗址公园，总投资达6.5亿元。

2011年8月1日，湖南省省水利厅批复《城头山遗址保护与利用项目水土保持方案》。

2021年7月11日，结合专家评审和网络投票，城头山古文化遗址被列为湖南省十大考古发现名单。

2021年10月12日，入选国家文物局《大遗址保护利用“十四五”专项规划》“十四五”时期大遗址”名单。

1997年7月28日，在北京召开的“城头山古文化遗址学术意义专家论证会”上，中国八位考古专家认为：“城头山遗址是中国已发现的历史最早、保存最完整、内涵最丰富的古城址。”

2001年3月29日，城头山遗址被评为“中国二十世纪100项考古大发现”之一，其考古发掘成果被记载到北京中华世纪坛的青铜甬道上，写进了大学和中学的历史教科书。

张忠培：该城的发掘就有了很重要的价值，它带动也长江流域考古学研究，十分重要，使我们开阔了眼界。

安志敏：城头山遗址非常重要，它在中国古代文化发展当中是一个重要环节，新石器时代城起源比较早，国内还没有发现一万年的古城，城头山是最早的。

任式楠：6000多年的水稻遗迹，稻作文化是我们中华民族一个很重要的文化，城头山那么清楚的稻作遗迹，其发现价值是很高的，就中国来讲，这是一个前沿性的课题。

严文明：城头山的重要性很少有遗址比得上。一是从城的角度上讲是中国最早的城址。它有四次建成，一次一次加高，工艺非常强。第二个是水稻田，中国是世界水稻最多的地区，而中国的水稻田一直没找到，现终于在城头山找到了，它还有一系列设备连成的一个系统，里面还有稻谷的植物硅酸体。再说里面的房子，保存得更好的中国也有不少，那是在北方，但是在江南这是唯一的。

张学海：到目前为止，没有第二个地方象城头山这样能解决中国城的起源问题，城头山这里有古文化、古城、古国的发展史。

何介钧：城头山古遗址不仅对史前聚落的发展、筑城历史和技术、长江流域文明因素的形成、稻作农业的兴起和发展等学术课题的研究具有重要价值，而且具有向广大群众展示和进行历史唯物主义、爱国主义教育的优越条件。

城头山园区正在建设，预计2015年下半年开园

春冬季：8:30—17:00

夏秋季：8:30—17:30

城头山国家考古遗址公园位于澧县县城西北12公里的车溪乡城头山村。

公交线路：澧县汽车北站内乘坐大坪方向客车。

2021年10月，被评为“百年百大考古发现”。