每年，科学院会通过“一般选举”选出最多20位新院士，并额外通过“特殊选举”选出最多4位院士。

提名为“院士制”，即只有科学院的院士可以提名候选人。因此科学院鼓励全体院士提名来自全国各地、不同专业背景的候选人。此外，为了选拔来自不同背景的候选人，科学院每年邀请超过200位澳大利亚STEM学科和高等教育领袖，在六月中旬前推荐可能的候选人。科学院的“多样性倡导者”（由每个领域委任的院士组成）将评估推荐候选人是否适合参加选举，并确定一名院士负责候选人的提名工作。这涉及与候选人密切合作进行提名，在线提名系统7月31日开始，申请人必须于 8 月 31 日之前提交完整提名信息。每年，科学院理事会可以在杰出的海外科学家中选出两位“外籍院士”(Corresponding Members)，当选前，候选人经过最多5轮选举。