他的结局也算凄惨，第二次华山论剑之时，他与其它三人被老顽童周伯通拿住，交给丘处机、王处一等看守，监禁在终南山重阳宫中，要他们改过自新，这才释放。他们四人恶性难除，千方百计地设法脱逃，但每次均给追了回来。第三次脱逃之时，灵智上人杀了几名看守的全真弟子。全真教的道人为惩过恶，打折了他一腿，又损了他的眼睛，这位心智武功俱毒的大喇嘛晚景一定很凄凉。

走到花厅门口，灵智上人忽道：“道长功力精奥，出神入化，令人拜服之至。”双手合什，施了一礼，突然双掌一撤，一股劲风猛然袭到。王处一暗叫：“不妙！”举手回礼，也是运力于掌，要以数十年修习的内功化开他双掌的袭击。两股劲风刚一接触，灵智上人突然变内力为外功，右掌斗然一伸，来抓王处一手腕。对方来得迅速，王处一变招也快捷之至，反手勾腕，强对强，硬碰硬，两人手腕一搭上，立即分开。灵智上人脸色微变，说道：“佩服，佩服！”一跃退开。

王处一微笑道：“大师名满江湖，怎么说了话不算数？”灵智上人怒道：“我不是留这姓郭的小子，我是要留你……”他被王处一掌力一震，已经受伤，假如静神定心，调匀吸呼，一时还不致发作，但被王处一这么一激，怒气上冲，一言未毕，竟自喷出了一口鲜血。王处一不敢停留，牵了郭靖的手，急步走出府门。

-------------【弯弓射雕】《旧版射雕英雄传》第三十三回　各显神通

灵智上人抢上前去，双手一拦，冷笑道：“你又哭又笑、疯疯癫癫的闹些甚么？”完颜洪烈叫道：“上人，且莫……”一言未毕，只见黄药师右手伸出，又已抓住了灵智上人颈后的那块肥肉，转了半个圈子，将他头下脚上的倒转了过来，向下掷去，扑的一声，他一个肥肥的光脑袋已插入船板之中，直没至肩。原来灵智上人所练武功，颈后是破绽所在，他身形一动，欧阳锋、周伯通、黄药师等大高手立时瞧出，是以三人一出手便都攻击他这弱点，都是一抓即中。----第二十二回　骑鲨遨游

各人早已洗手完毕，他一双手仍浸在盆里，众人见他若有所思，都有点奇怪。过了一会，他那只金盆中忽有一缕缕的水气上升。再过一阵，盆里水气愈冒愈盛。片刻之间，盆里发出微声，小水泡一个个从盆底冒上。【王处一暗暗心惊：“这和尚内功好生了得！事不宜迟，我非先发制人不可】。

一个粗厚低沉的声音道：“欧阳公子别在老衲脸上贴金啦，【我跟这道士大家吃了亏，半斤八两，谁也没赢】。”欧阳克道：“总之他不丧命就落个残废，上人却只须静养些时日。”

【两人本来功力悉敌】，沙通天身子直立，占了便宜，但灵智上人却有备而发，打了他一个措手不及。这一来仍然是半斤八两，只听得拍的一响，沙通天退后三步，一交坐倒，灵智上人也被他掌力一震，横卧在地。

【灵智上人自恃掌力造诣深厚】，【兼之手上有毒】，当即挥掌拍出，斗觉胸口气窒，臂膀酸麻，手掌软软垂下，腕上关节已被震脱，【毒掌功夫竟是半点没能使上】。