主人公是个以气象预测员为志愿，只有体力能自豪的普通少年。他周围都是个性丰富的朋友，干着傻事同时也欢乐度过着充实的学园生活。在第一学期完结之际的某一日，主人公的班上来了一位女孩子转校生ともえ。而在她来了之后，不知为什么在她的周围常发生各样的麻烦事故。主人公一开始还以为是偶然，但却渐渐怀疑是和转校生有关联性。随着调查的进展疑惑渐变成确信。最后，在观测史上最大的台风在南洋形成。一直线地往ともえ——主人公们住的街以高速逼近。

面对未曾有过的大灾害而震荡的日本全国，以及要将ともえ作为危险人物排除开始行动的日本政府，还有反而在想是不是可以利用那能力的一些人——在混入了各种势力欲望的乱况中，主人公们能用智慧、勇气、爱和友情跨越这个大危机吗？