他反对幕府时期封建主压迫和剥削农民，主张反对“现世”和对维护“现世”的儒释基督教等理论进行批判，主张人人平等，尊重农业耕作。他认为，古时的社会关系是“自然的”，而后来出现的阶级、君臣等等之间的社会关系，则是“不自然的”。他倾向于社会主义，认为社会主义思想，是一种“从世界伊始几千年来从未间断过而逐渐积累起来的弊端等所激起的学说”，他指出有弊端的社会必然要会被更为合理的社会——“共产主义”所取代，因此他写到，“共产主义不久就要实现”。他重视道德在社会生活中的作用，以为自古以来，抑制恶事的方法有三，即第一依靠道德，第二依靠宗教，第三依靠法律，凡在这三种方法以外的都不加考虑。

狩野亨吉开始，京都大学文科大学就重视以中国为中心的东洋学研究，狩野亨吉为文科大学的发展不遗余力，勇于打破学历等硬性条件的束缚，破格聘用了只有秋田师范学校学历的内藤湖南等学者，内藤氏后来成为京都大学东洋学的主要创始人之一。