1999年由台湾宜兰草湖玉尊宫管委会捐资600多万元人民币重建。新修后的玉尊宫占地10亩，建筑面积300多平方米。玉尊宫殿内五个神阁均用檀香木群雕构成，共雕塑2万多种花草树木、飞禽走兽，雕塑造型多姿多态，形象各异，无一雷同；殿中两根蟠龙古石柱是唐代遗留下来的文物，距今已有1000多年的历史；殿门进口处两侧，分别置有两只石麒麟、两 只石象和两只石鼓；殿堂三重庙顶，用琉璃瓦铺盖，中梁与屋檐用瓷片雕塑、剪贴各种神兽造型，色彩斑斓，神态逼真。整座宫宇的石、木、瓷三雕建筑具有很高的艺术欣赏价值。

玉尊宫初名开元观，唐高宗年间肇建于漳浦县李澳川。唐贞元二年（公元786年）迁建于州城西隅做荞巷，明洪武二十年改为今名。公元1919年，援闽粤军陈炯明部驻扎漳州，玉尊宫被毁。后经信众商议在天宝镇五里沙村后坑社建简易庙宇。